RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449508.1

TOM1-211, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 4

Gene TOM1, Length 593 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-211ENST00000449508 EBF1Q9UH73 591 aa14.5□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ANTXRLA6NF34 631 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 GDF9O60383 454 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 KAT7O95251 611 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 APODP05090 189 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 IRF1P10914 325 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ADH5P11766 374 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 CD58P19256 250 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TUBP50607 506 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 GAD2Q05329 585 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 INCA1Q0VD86 236 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 CCDC6Q16204 474 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 OTUB2Q96DC9 234 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TWNKQ96RR1 684 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.49□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 SLC30A4O14863 429 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 DCLK1O15075 740 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TLR5O60602 858 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 EPN2O95208 641 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TBX18O95935 607 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ZNF806P0C7X5 589 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TIE1P35590 1138 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 PGFP49763 221 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ENPEPQ07075 957 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 MESP2Q0VG99 397 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 PNOCQ13519 176 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 PLK5Q496M5 336 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 KRT39Q6A163 491 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 C12orf40Q86WS4 652 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TTC30AQ86WT1 665 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 NAT16Q8N8M0 369 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 WBP2Q969T9 261 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 INVSQ9Y283 1065 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.48□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 A0A0A0MRY4 1105 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 CETN3O15182 167 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 CILPO75339 1184 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 RHOBTB1O94844 696 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 GBP1P32455 592 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 GTF2H1P32780 548 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 GRIA2P42262 883 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 KDSRQ06136 332 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ELF2Q15723 593 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 CRY1Q16526 586 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ANO4Q32M45 955 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ZNF394Q53GI3 561 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 EMC10Q5UCC4 262 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ANO7Q6IWH7 933 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 ALLCQ8N6M5 410 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 WHAMMQ8TF30 809 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 RMND1Q9NWS8 449 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 SCML2Q9UQR0 700 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 THADAQ6YHU6 1953 aa14.47□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 HHLA1C9JL84 531 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 STX10O60499 249 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 PRCPP42785 496 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TNFRSF4P43489 277 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 HTR3DQ70Z44 454 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 TMEM25Q86YD3 366 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.46□□□□□ -0.09
TOM1-211ENST00000449508 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms