RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 NDUFV1P49821 464 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 PTK7Q13308 1070 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 DCLK2Q8N568 766 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 PAFAH2Q99487 392 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SIPA1L1O43166 1804 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 CYB561D2O14569 222 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 RPS6KA5O75582 802 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 NCAM1P13591 858 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 THPOP40225 353 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 CNGA2Q16280 664 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 CD302Q8IX05 232 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 PGBD4Q96DM1 585 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 ERP27Q96DN0 273 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 LGMNQ99538 433 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 TSC22D3Q99576 134 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 CFAP69A5D8W1 941 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 ATG7O95352 703 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 MCF2P10911 925 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 ADRA1DP25100 572 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 STAT4Q14765 748 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 KLC2Q9H0B6 622 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 VPS11Q9H270 941 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 FZD8Q9H461 694 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 CDKN2BP42772 138 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 GBE1Q04446 702 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 DEFB106AQ8N104 65 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM237Q96Q45 408 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SPC25Q9HBM1 224 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 MFSD10Q14728 455 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 CNPY3Q9BT09 278 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 AAASQ9NRG9 546 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SOCS7O14512 581 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 TPH1P17752 444 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 TMPRSS15P98073 1019 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 CAV1Q03135 178 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 VPS52Q8N1B4 723 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 TTC13Q8NBP0 860 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 COPEO14579 308 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 MMP3P08254 477 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP2F1P24903 491 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 RSAD1Q9HA92 442 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.152e-6■■□□□ 12.9
RABGEF1-210ENST00000437078 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 DFFAO00273 331 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 CILPO75339 1184 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 PYGBP11216 843 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 DRD4P21917 467 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 PAX3P23760 479 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 OLIG2Q13516 323 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 MSS51Q4VC12 460 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 KAT2BQ92831 832 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 MAML3Q96JK9 1138 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 KPNA7A9QM74 516 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 GOT1P17174 413 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 SCTRP47872 440 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-210ENST00000437078 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms