RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PLLPQ9Y342 182 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa15.54■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 KRT7P08729 469 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ABCD1P33897 745 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ERFP50548 548 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 DPYSL3Q14195 570 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TAZQ16635 292 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 THNSL1Q8IYQ7 743 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 UBR7Q8N806 425 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 NDNQ99608 321 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ZWILCHQ9H900 591 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF541Q9H0D2 1346 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CNTN2Q02246 1040 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 EMC2Q15006 297 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SMTNL2Q2TAL5 461 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SEZ6Q53EL9 994 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TEX44Q53QW1 395 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ABHD15Q6UXT9 468 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 RAPH1Q70E73 1250 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 FAM71DQ8N9W8 422 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 OR6Y1Q8NGX8 325 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 EBF3Q9H4W6 596 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SIRPGQ9P1W8 387 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 STYXL1Q9Y6J8 313 aa15.53■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SERPINA6P08185 405 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 WEE2P0C1S8 567 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 KDELR1P24390 212 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 BRD2P25440 801 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 AQP5P55064 265 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 DLK2Q6UY11 383 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PDSS2Q86YH6 399 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CRLF3Q8IUI8 442 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TRPM4Q8TD43 1214 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CGRRF1Q99675 332 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PDLIM7Q9NR12 457 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa15.52■□□□□ 0.08
TOP3B-206ENST00000436282 KRT37O76014 449 aa15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PSMA2P25787 234 aa15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CHI3L2Q15782 390 aa15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 XKR3Q5GH77 459 aa15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP157Q5JU67 520 aa15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 FAM172AQ8WUF8 416 aa15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 OPTNQ96CV9 577 aa15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CDHR1Q96JP9 859 aa15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 S100A14Q9HCY8 104 aa15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF180Q9UJW8 692 aa15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SOX13Q9UN79 622 aa15.52■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 C1QAP02745 245 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 IL1R2P27930 398 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CCNFP41002 786 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP8P85298 464 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 LSAMPQ13449 338 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 HADHQ16836 314 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 KCNT1Q5JUK3 1230 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CES4AQ5XG92 561 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 DHDDSQ86SQ9 333 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A41Q8N5S1 370 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 STKLD1Q8NE28 680 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 FAM81AQ8TBF8 368 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MKS1Q9NXB0 559 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MCF2LO15068 1137 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 LRCH4O75427 683 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 STAM2O75886 525 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 APOC2P02655 101 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 NCOA4Q13772 614 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 HIC1Q14526 733 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CYP4A22Q5TCH4 519 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 RASSF3Q86WH2 238 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 DEPTORQ8TB45 409 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 APBB2Q92870 758 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 GGA3Q9NZ52 723 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SORCS3Q9UPU3 1222 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 TTLL3Q9Y4R7 772 aa15.51■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 A0A088AWK7 358 aa15.5■□□□□ 0.07
TOP3B-206ENST00000436282 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms