RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429285.6

NCOR2-208, Transcript of nuclear receptor corepressor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOR2, Length 8,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR2-208	ENST00000429285	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	UBE2QL1	A1L167	161 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	TPST1	O60507	370 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	POLG2	Q9UHN1	485 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	EXTL3	O43909	919 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CACNA2D1	P54289	1103 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	MROH9	Q5TGP6	573 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	POTEH	Q6S545	545 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	RAD18	Q9NS91	495 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	RAD51C	O43502	376 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	RASA2	Q15283	850 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	PCSK7	Q16549	785 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC157	Q569K6	752 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM114	B3SHH9	223 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	ATG7	O95352	703 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	AKR1B1	P15121	316 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	POU1F1	P28069	291 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	PLIN5	Q00G26	463 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	C9orf72	Q96LT7	481 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	TBX3	O15119	743 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	RHOBTB3	O94955	611 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF284	Q2VY69	593 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	ATP9A	O75110	1047 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CD4	P01730	458 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	RBP1	P09455	135 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	GTF2H1	P32780	548 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CPA2	P48052	419 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	SNAP91	O60641	907 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	FMO5	P49326	533 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	NFYC	Q13952	458 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	HAVCR1	Q96D42	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	EPB42	P16452	691 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	GRM4	Q14833	912 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	KLHL1	Q9NR64	748 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	VPS26A	O75436	327 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	AMER2	Q8N7J2	671 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM253	P0C7T8	217 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	GRK4	P32298	578 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CDK7	P50613	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CCNG1	P51959	295 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	MAPK11	Q15759	364 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	GAN	Q9H2C0	597 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	GALC	P54803	685 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	PADI4	Q9UM07	663 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21	3e-6	■■■■□ 19.3
NCOR2-208	ENST00000429285	CPD	O75976	1380 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NCOR2-208	ENST00000429285	PHKG2	P15735	406 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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