RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 CEP83Q9Y592 693 aa31.64■■■□□ 2.65
PKDCC-202ENST00000401498 HDCP19113 662 aa31.63■■■□□ 2.65
PKDCC-202ENST00000401498 CASP14P31944 242 aa31.63■■■□□ 2.65
PKDCC-202ENST00000401498 AVPR1AP37288 418 aa31.63■■■□□ 2.65
PKDCC-202ENST00000401498 ACADSBP45954 432 aa31.63■■■□□ 2.65
PKDCC-202ENST00000401498 ZBED6P86452 979 aa31.63■■■□□ 2.65
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PKDCC-202ENST00000401498 ZFP14Q9HCL3 533 aa31.63■■■□□ 2.65
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PKDCC-202ENST00000401498 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
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PKDCC-202ENST00000401498 HECTD3Q5T447 861 aa31.62■■■□□ 2.65
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PKDCC-202ENST00000401498 TRIOO75962 3097 aa31.61■■■□□ 2.65
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PKDCC-202ENST00000401498 E7ENQ6 273 aa31.6■■■□□ 2.65
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PKDCC-202ENST00000401498 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP31.6■■■□□ 2.65
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PKDCC-202ENST00000401498 PTPN20Q4JDL3 420 aa31.6■■■□□ 2.65
PKDCC-202ENST00000401498 SYT11Q9BT88 431 aa31.6■■■□□ 2.65
PKDCC-202ENST00000401498 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
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PKDCC-202ENST00000401498 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP31.6■■■□□ 2.65
PKDCC-202ENST00000401498 CLIC5Q9NZA1 410 aa31.6■■■□□ 2.65
PKDCC-202ENST00000401498 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
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PKDCC-202ENST00000401498 ARHGAP18Q8N392 663 aa31.6■■■□□ 2.65
PKDCC-202ENST00000401498 SLC44A3Q8N4M1 653 aa31.6■■■□□ 2.65
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PKDCC-202ENST00000401498 RARGP13631 454 aa31.59■■■□□ 2.65
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM14Q14142 442 aa31.59■■■□□ 2.65
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PKDCC-202ENST00000401498 OLIG1Q8TAK6 271 aa31.59■■■□□ 2.65
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PKDCC-202ENST00000401498 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
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PKDCC-202ENST00000401498 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
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PKDCC-202ENST00000401498 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
PKDCC-202ENST00000401498 RIN3Q8TB24 985 aa31.56■■■□□ 2.64
PKDCC-202ENST00000401498 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP31.56■■■□□ 2.64
PKDCC-202ENST00000401498 E2F7Q96AV8 911 aa31.56■■■□□ 2.64
PKDCC-202ENST00000401498 OBP2AQ9NY56 170 aa31.56■■■□□ 2.64
PKDCC-202ENST00000401498 SORCS3Q9UPU3 1222 aa31.56■■■□□ 2.64
PKDCC-202ENST00000401498 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
PKDCC-202ENST00000401498 ERICH1Q86X53 443 aa31.56■■■□□ 2.64
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