RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 HSF1Q00613 529 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-202ENST00000368205 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-202ENST00000368205 CFHR3Q02985 330 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-202ENST00000368205 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-202ENST00000368205 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-202ENST00000368205 STAP2Q9UGK3 403 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-202ENST00000368205 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-202ENST00000368205 CDY1Q9Y6F8 540 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-202ENST00000368205 TNIKQ9UKE5 1360 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRK-202ENST00000368205 CKAP5Q14008 2032 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC88BA6NC98 1476 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 H3BML4 177 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 CREB1P16220 341 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 UQCRC1P31930 480 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 SLC13A2Q13183 592 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 RAB32Q13637 225 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 KCNB1Q14721 858 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 COLCA1Q6ZS62 124 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 KRT78Q8N1N4 520 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 PELI3Q8N2H9 469 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 DNAJB14Q8TBM8 379 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF112Q9UJU3 913 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 ABCC8Q09428 1581 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 MTHFSP49914 203 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 SMARCA2P51531 1590 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 MTX1Q13505 466 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 CEP162Q5TB80 1403 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 DENND1CQ8IV53 801 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 MMP21Q8N119 569 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 WDYHV1Q96HA8 205 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 KAZALD1Q96I82 304 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 CAMK1GQ96NX5 476 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 CTAGE1Q96RT6 745 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 SOGA1O94964 1423 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 A0A1W2PPL8 197 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM233B4DJY2 109 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 SRGAP2O75044 1071 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 PF4V1P10720 104 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 NCLP19338 710 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 HTR1BP28222 390 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 INSCQ1MX18 579 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF750Q32MQ0 723 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 ADHFE1Q8IWW8 467 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 MPP5Q8N3R9 675 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 HIC2Q96JB3 615 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 SMARCA4P51532 1647 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 CCP110O43303 1012 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 TBC1D4O60343 1298 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 UBXN7O94888 489 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 TNFRSF1BP20333 461 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 TACR3P29371 465 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 NEK2P51955 445 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 DAAM2Q86T65 1068 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 MAML1Q92585 1016 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 VPS33BQ9H267 617 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 HOMER2Q9NSB8 354 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 EEA1Q15075 1411 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 A8MVJ9 347 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 PRSS44E7EML9 344 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 CLIC1O00299 241 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 FGF2P09038 288 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 T-ENOLP0DO92 83 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 YPEL5P62699 121 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRK-202ENST00000368205 B4GALNT1Q00973 533 aa4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms