RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSG6Q00889 435 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF543Q08ER8 600 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMAN2Q12907 356 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 ST3GAL2Q16842 350 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHSY1Q86X52 802 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 GALNT4Q8N4A0 578 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 VGLL2Q8N8G2 317 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDYHV1Q96HA8 205 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 RITA1Q96K30 269 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASB2Q96Q27 587 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEMA4CQ9C0C4 833 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 LPAR3Q9UBY5 353 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 STEAP1Q9UHE8 339 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS51Q9UID3 782 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLCA1A8K7I4 914 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 A8MVJ9 347 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRRT4C9JH25 899 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 APAF1O14727 1248 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMM2O15305 246 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 GCATO75600 419 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 LATS1O95835 1130 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CELA2AP08217 269 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP2D6P10635 497 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC5A1P13866 664 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHKG2P15735 406 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNALP38405 381 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRIM2P49643 509 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 DIO1P49895 249 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CASP5P51878 434 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MANEALQ5VSG8 457 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF66Q6ZN08 573 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP49Q70CQ1 688 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf44Q8N8P7 122 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP11CQ8NB49 1132 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC46Q96FV0 321 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SELENOOQ9BVL4 669 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASIC5Q9NY37 505 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MGAT4CQ9UBM8 478 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBB4AP04350 444 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYL4P12829 197 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGFR2P21802 821 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 YY1P25490 414 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCM5P33992 734 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 STT3AP46977 705 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 COPB1P53618 953 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLCA4Q14CN2 919 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM187BQ17R55 369 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEP78Q5JTW2 689 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM65Q6PI78 240 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 KSR2Q6VAB6 950 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 BEND5Q7L4P6 421 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT28Q7Z3Y7 464 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PJA1Q8NG27 643 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZDHHC12Q96GR4 267 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS50Q96JG6 964 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM227BQ96M60 508 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 C5orf34Q96MH7 638 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 HS6ST2Q96MM7 605 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBCBQ99426 244 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRIP3Q9NQ35 241 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A087WZ62 844 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PPC4 97 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 BTBD19C9JJ37 291 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM232C9JQI7 657 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP6CO00743 305 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 APOL1O14791 398 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAMTS3O15072 1205 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAND2O75155 1236 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT-CO3P00414 261 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT18P05783 430 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYL3P08590 195 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR35P0CG20 571 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADRA1DP25100 572 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPGP29372 298 aa3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms