RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCD5Q86SK9 330 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 IER2Q9BTL4 223 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO15AQ9UKN7 3530 aa20.59■□□□□ 0.89
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SP9P0CG40 484 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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PTPRCAP-201ENST00000326294 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZS52 159 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.59■□□□□ 0.89
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PTPRCAP-201ENST00000326294 NACA2Q9H009 215 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa20.59■□□□□ 0.89
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PTPRCAP-201ENST00000326294 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 MBD3O95983 291 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP17A1P05093 508 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 RARGP13631 454 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC9A1P19634 815 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G4AP47712 749 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC8A3P57103 927 aa20.58■□□□□ 0.89
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PTPRCAP-201ENST00000326294 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.58■□□□□ 0.89
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PTPRCAP-201ENST00000326294 GJB7Q6PEY0 223 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 GBP6Q6ZN66 633 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBA3Q8TBC4 463 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAGPAQ9UK23 515 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.58■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 E2F8A0AVK6 867 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 PROB1E7EW31 1015 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SETSIPP0DME0 302 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRF1P10914 325 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSEN1P49768 467 aa20.57■□□□□ 0.88
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PTPRCAP-201ENST00000326294 AMPD2Q01433 879 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAB4Q2WGN9 574 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 MIIPQ5JXC2 388 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 DMDP11532 3685 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 PON1P27169 355 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADIGQ0VDE8 80 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNGA2Q16280 664 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF276Q8N554 614 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIX2Q9NPC8 291 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNJ18B7U540 433 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0QYV0 167 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 GREM1O60565 184 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 EGFP01133 1207 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT5P13647 590 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALK1P51570 392 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR1H3Q13133 447 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNJ12Q14500 433 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHCR24Q15392 516 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 STILQ15468 1287 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.55■□□□□ 0.88
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