RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321027.7

GCFC2-201, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GCFC2, Length 4,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2-201ENST00000321027 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 ZBTB10Q96DT7 871 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 KCNK16Q96T55 309 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 CYP39A1Q9NYL5 469 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 KLK14Q9P0G3 267 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 A0A087WZ62 844 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 CXCL11O14625 94 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 CDC42EP1Q00587 391 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 SLC7A14Q8TBB6 771 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 TRPM4Q8TD43 1214 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 NDFIP2Q9NV92 336 aa15.94■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 GRIN2DO15399 1336 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 STAG3L1P0CL83 205 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 NFIL3Q16649 462 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 SH3GL3Q99963 347 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 CYP2C8P10632 490 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 INSRRP14616 1297 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 CREB1P16220 341 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 MIPP30301 263 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 ZNF235Q14590 738 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 C6orf10Q5SRN2 563 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 CEP19Q96LK0 163 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 OLFM3Q96PB7 478 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 DPP3Q9NY33 737 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 IRF6O14896 467 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 TM9SF1O15321 606 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 KRT16P08779 473 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 GTF2A2P52657 109 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 BTKQ06187 659 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 LAYNQ6UX15 382 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 POU5F2Q8N7G0 328 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 ASIC4Q96FT7 647 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 CPB2Q96IY4 423 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 PHLPP1O60346 1717 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 UNC5CO95185 931 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 VDRP11473 427 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 ATP6V1B1P15313 513 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 PTGER2P43116 358 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 JAM2P57087 298 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 OCA2Q04671 838 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 PDK1Q15118 436 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 IL31Q6EBC2 164 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 MOSPD1Q9UJG1 213 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.93■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 H3BRB1 525 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 ENTPD5O75356 428 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 TMEM132BQ14DG7 1078 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 PTPRN2Q92932 1015 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 ZNF484Q5JVG2 852 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 GRAMD4Q6IC98 578 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 EME1Q96AY2 570 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 DACH2Q96NX9 599 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 RRN3P2A6NIE6 340 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 CPB1P15086 417 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 ACADSP16219 412 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 ZBTB17Q13105 803 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 TTC30BQ8N4P2 665 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 SIX2Q9NPC8 291 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 SCN11AQ9UI33 1791 aa15.92■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 LIASO43766 372 aa15.91■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 ZNF286BP0CG31 522 aa15.91■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 GLRBP48167 497 aa15.91■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 NUDT2P50583 147 aa15.91■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 DAB2P98082 770 aa15.91■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 ANO4Q32M45 955 aa15.91■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 NOTUMQ6P988 496 aa15.91■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 C16orf87Q6PH81 154 aa15.91■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 IPMKQ8NFU5 416 aa15.91■□□□□ 0.14
GCFC2-201ENST00000321027 GANCQ8TET4 914 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms