RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 VTI1AQ96AJ9 217 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FAF2Q96CS3 445 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CMTM5Q96DZ9 223 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ACCSQ96QU6 501 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM79Q9BSE2 394 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PPCSQ9HAB8 311 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 EP400Q96L91 3159 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 WDR64B1ANS9 1081 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MCF2P10911 925 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 NUP107P57740 925 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GSTM4Q03013 218 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 DLGAP5Q15398 846 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CPNE9Q8IYJ1 553 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF786Q8N393 782 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 EXD1Q8NHP7 514 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PGBD4Q96DM1 585 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MCEEQ96PE7 176 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CDRT15Q96T59 188 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PNPOQ9NVS9 261 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TNS2Q63HR2 1409 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 BCORQ6W2J9 1755 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SH3PXD2BA1X283 911 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 F8VP50 259 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 H7C0C1 242 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ITM2AO43736 263 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 THRAP10827 490 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CDH3P22223 829 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RPL10P27635 214 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ATP5OP48047 213 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ITGADQ13349 1161 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FERMT1Q9BQL6 677 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC106Q9BWC9 280 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PSTPIP1O43586 416 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 UGT1A9O60656 530 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ETFBP38117 255 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 XIAPP98170 497 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CHSY1Q86X52 802 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RCOR2Q8IZ40 523 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MYO1HQ8N1T3 1032 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FBXL13Q8NEE6 735 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 DEPTORQ8TB45 409 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CPT1BQ92523 772 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SHC3Q92529 594 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 UGT1A7Q9HAW7 530 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 UGT1A10Q9HAW8 530 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 UGT1A8Q9HAW9 530 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ADA2Q9NZK5 511 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PSMD13Q9UNM6 376 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 EFR3BQ9Y2G0 817 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SIN3BO75182 1162 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PADI6Q6TGC4 694 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FRMD7Q6ZUT3 714 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PCGF5Q86SE9 256 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 IGDCC3Q8IVU1 814 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SLC15A3Q8IY34 581 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 BBS5Q8N3I7 341 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FBXW8Q8N3Y1 598 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF276Q8N554 614 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FAM156AQ8NDB6 213 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ATP2A3Q93084 1043 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 C8orf37Q96NL8 207 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 NACC1Q96RE7 527 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SERPINI1Q99574 410 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PCDH9Q9HC56 1237 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ACSS2Q9NR19 701 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MATN2O00339 956 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM63AO94886 807 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ADRB2P07550 413 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CFHP08603 1231 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RPL22P35268 128 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms