RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266058.8

SLIT1-201, Transcript of slit guidance ligand 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLIT1, Length 7,925 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT1-201ENST00000266058 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 IER5Q5VY09 327 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 NDUFB10O96000 172 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 GYPCP04921 128 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 ACADSBP45954 432 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 NME5P56597 212 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 TRIM24O15164 1050 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 MAP3K6O95382 1288 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 TC2NQ8N9U0 490 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 KCNB2Q92953 911 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 PIF1Q9H611 641 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 TNNI3P19429 210 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 HPDLQ96IR7 371 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 TGM2P21980 687 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 ISCUQ9H1K1 167 aa14.65□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 DSG1Q02413 1049 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 CHRNA5P30532 468 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 ZNF544Q6NX49 715 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 GJA1P17302 382 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 IRAK1P51617 712 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 SP8Q8IXZ3 490 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 ZW10O43264 779 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 EXTL3O43909 919 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 LBPP18428 481 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 CDC42EP1Q00587 391 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 USP49Q70CQ1 688 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 SNX6Q9UNH7 406 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 KLRC1P26715 233 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 VHLP40337 213 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 RNF112Q9ULX5 631 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 GH1P01241 217 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 PCNAP12004 261 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 WEE1P30291 646 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 IL12RB1P42701 662 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 CENPCQ03188 943 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 CYP51A1Q16850 503 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 FAM136AQ96C01 138 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.64□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 NPTXRO95502 500 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 HSD17B3P37058 310 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 FAPQ12884 760 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 DKK3Q9UBP4 350 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 VPS33BQ9H267 617 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 ITGB3P05106 788 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 TMEM253P0C7T8 217 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 IGFBP4P22692 258 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 RGS2P41220 211 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 ARMC3Q5W041 872 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 MRGBPQ9NV56 204 aa14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLIT1-201ENST00000266058 ZNF609O15014 1411 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms