RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261726.10

CUX2-201, Transcript of cut like homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX2, Length 6,844 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2-201ENST00000261726 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 FNTAP49354 379 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 C4orf22Q6V702 233 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 AGRPO00253 132 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 SEMA3FQ13275 785 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 LPAR1Q92633 364 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 POLG2Q9UHN1 485 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 C19orf81C9J6K1 198 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 PLA2G6O60733 806 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CLTBP09497 229 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ITGB6P18564 788 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 OXCT1P55809 520 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 THAP2Q9H0W7 228 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 RAP1GAPP47736 663 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CCT8P50990 548 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CCL15Q16663 113 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MTSS1LQ765P7 747 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 DDI1Q8WTU0 396 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CD248Q9HCU0 757 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 AAASQ9NRG9 546 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ZNF521Q96K83 1311 aa14.73□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 RHOBTB3O94955 611 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 DDI2Q5TDH0 399 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ACOX2Q99424 681 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 FICDQ9BVA6 458 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ISCUQ9H1K1 167 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 HACL1Q9UJ83 578 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 HBP1O60381 514 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 THRAP10827 490 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 IL5RAQ01344 420 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ACOT1Q86TX2 421 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ADGRB1O14514 1584 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 VAC14Q08AM6 782 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 UCMAQ8WVF2 138 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 TMEM169Q96HH4 297 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 NCAPD2Q15021 1401 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 KLHL41O60662 606 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 FAR2Q96K12 515 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 GGA3Q9NZ52 723 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 KCND2Q9NZV8 630 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 FAM20BO75063 409 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 BAIAP3O94812 1187 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CKMP06732 381 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 PNPLA4P41247 253 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 NUP107P57740 925 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 ZNF677Q86XU0 584 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 VPS28Q9UK41 221 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 KIF20BQ96Q89 1820 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 PCDH8O95206 1070 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 SLC2A3P11169 496 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CCNG1P51959 295 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 NR1I3Q14994 352 aa14.72□□□□□ -0.05
CUX2-201ENST00000261726 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms