RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251287.2

HCN2-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium and sodium channel 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN2, Length 3,408 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2-201ENST00000251287 SOX10P56693 466 aa20.15■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.15■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.14■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 CSPG5O95196 566 aa20.14■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 SERPINB5P36952 375 aa20.14■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 HALP42357 657 aa20.14■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 PRAMEP78395 509 aa20.14■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 FAM156AQ8NDB6 213 aa20.14■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 ADAM32Q8TC27 787 aa20.14■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 PGBD4Q96DM1 585 aa20.14■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 ZNF536O15090 1300 aa20.14■□□□□ 0.82
HCN2-201ENST00000251287 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 H3BNX3 289 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 CNTN3Q9P232 1028 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 UFL1O94874 794 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 ITGAXP20702 1163 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 NUDT2P50583 147 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 CD300CQ08708 224 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 EML3Q32P44 896 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 OGFOD2Q6N063 350 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 PLLPQ9Y342 182 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 GOLGA8OA6NCC3 632 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 GOLGA8NF8WBI6 632 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 LSM1O15116 133 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SPTLC1O15269 473 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 ARP10275 920 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 AP3B2Q13367 1082 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 FAIMQ9NVQ4 179 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 CEPT1Q9Y6K0 416 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 THRAP10827 490 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 C6orf183Q5T699 404 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 NEMP1O14524 444 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 GDF11O95390 407 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 TNNI1P19237 187 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SREBF1P36956 1147 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 POTEHQ6S545 545 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 TBX3O15119 743 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 KRT37O76014 449 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 CD48P09326 243 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 PRELPP51888 382 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 MARVELD2Q8N4S9 558 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 CALN1Q9BXU9 219 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 FBP2O00757 339 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 TMED10P49755 219 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 GSTM4Q03013 218 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 FLOT2Q14254 428 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SLC15A2Q16348 729 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 WRNIP1Q96S55 665 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 SETDB2Q96T68 719 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 TMEM247A6NEH6 219 aa20.11■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 RIMBP2O15034 1052 aa20.11■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 NFKBIAP25963 317 aa20.11■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 GNA15P30679 374 aa20.11■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 NR1H2P55055 460 aa20.11■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HCN2-201ENST00000251287 XKR5Q6UX68 686 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms