RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 MAP3K7CLP57077 242 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ENPEPQ07075 957 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 DPYDQ12882 1025 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 CRY1Q16526 586 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 PPM1JQ5JR12 505 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 C12orf29Q8N999 325 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ALDH1A2O94788 518 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ADRB1P08588 477 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 FAM200BP0CF97 657 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 GBP1P32455 592 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 ORC1Q13415 861 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 RASSF3Q86WH2 238 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1W2PQ27 194 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1W2PQ64 194 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1W2PQD8 194 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TLR5O60602 858 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 PRR29P0C7W0 189 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TIE1P35590 1138 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 GCLMP48507 274 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 CREB5Q02930 508 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 INCA1Q0VD86 236 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 ADAM9Q13443 819 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 EOGTQ5NDL2 527 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 ANO7Q6IWH7 933 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 C12orf40Q86WS4 652 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 ABCA7Q8IZY2 2146 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 ADORA2BP29275 332 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 BBS7Q8IWZ6 715 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 ALLCQ8N6M5 410 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 SPHK2Q9NRA0 654 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 DEC1Q9P2X7 70 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 SCML2Q9UQR0 700 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 INVSQ9Y283 1065 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 ANTXRLA6NF34 631 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF202O95125 648 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 CAVIN2O95810 425 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM49P0CI25 452 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM49CP0CI26 452 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 KDSRQ06136 332 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 PPP3CAQ08209 521 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 MESP2Q0VG99 397 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 ANO4Q32M45 955 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 STPG1Q5TH74 334 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 HTR3DQ70Z44 454 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TTC30AQ86WT1 665 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 NAT16Q8N8M0 369 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 SMOC1Q9H4F8 434 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 SGK1O00141 431 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 IRF1P10914 325 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 GTF2H1P32780 548 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 EMC10Q5UCC4 262 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 PMS2CLQ68D20 193 aa22.23■■□□□ 1.15
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