RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
PMS1-220ENST00000618056 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.05■■■■□ 3.36
PMS1-220ENST00000618056 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.05■■■■□ 3.36
PMS1-220ENST00000618056 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.05■■■■□ 3.36
PMS1-220ENST00000618056 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.98■■■■□ 3.35
PMS1-220ENST00000618056 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.98■■■■□ 3.35
PMS1-220ENST00000618056 PRAM1Q96QH2 718 aa35.97■■■■□ 3.35
PMS1-220ENST00000618056 NEUROD1Q13562 356 aa35.95■■■■□ 3.35
PMS1-220ENST00000618056 JCADQ9P266 1359 aa35.95■■■■□ 3.35
PMS1-220ENST00000618056 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.34
PMS1-220ENST00000618056 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.94■■■■□ 3.34
PMS1-220ENST00000618056 POGKQ9P215 609 aa35.92■■■■□ 3.34
PMS1-220ENST00000618056 SHPRHQ149N8 1683 aa35.91■■■■□ 3.34
PMS1-220ENST00000618056 ADGRB2O60241 1585 aa35.91■■■■□ 3.34
PMS1-220ENST00000618056 ORAI2Q96SN7 254 aa35.91■■■■□ 3.34
PMS1-220ENST00000618056 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.88■■■■□ 3.33
PMS1-220ENST00000618056 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
PMS1-220ENST00000618056 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.84■■■■□ 3.33
PMS1-220ENST00000618056 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.83■■■■□ 3.33
PMS1-220ENST00000618056 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
PMS1-220ENST00000618056 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.82■■■■□ 3.32
PMS1-220ENST00000618056 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
PMS1-220ENST00000618056 KIF1AQ12756 1690 aa35.8■■■■□ 3.32
PMS1-220ENST00000618056 NUTM2FA1L443 756 aa35.8■■■■□ 3.32
PMS1-220ENST00000618056 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
PMS1-220ENST00000618056 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.79■■■■□ 3.32
PMS1-220ENST00000618056 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.76■■■■□ 3.31
PMS1-220ENST00000618056 USP32Q8NFA0 1604 aa35.76■■■■□ 3.31
PMS1-220ENST00000618056 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.76■■■■□ 3.31
PMS1-220ENST00000618056 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.75■■■■□ 3.31
PMS1-220ENST00000618056 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
PMS1-220ENST00000618056 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
PMS1-220ENST00000618056 TONSLQ96HA7 1378 aa35.74■■■■□ 3.31
PMS1-220ENST00000618056 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
PMS1-220ENST00000618056 PXDNQ92626 1479 aa35.72■■■■□ 3.31
PMS1-220ENST00000618056 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
PMS1-220ENST00000618056 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.7■■■■□ 3.31
PMS1-220ENST00000618056 LRP6O75581 1613 aa35.7■■■■□ 3.3
PMS1-220ENST00000618056 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.69■■■■□ 3.3
PMS1-220ENST00000618056 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
PMS1-220ENST00000618056 FOXO3O43524 673 aa35.69■■■■□ 3.3
PMS1-220ENST00000618056 ILDR2Q71H61 639 aa35.68■■■■□ 3.3
PMS1-220ENST00000618056 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.66■■■■□ 3.3
PMS1-220ENST00000618056 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.66■■■■□ 3.3
PMS1-220ENST00000618056 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
PMS1-220ENST00000618056 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
PMS1-220ENST00000618056 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.62■■■■□ 3.29
PMS1-220ENST00000618056 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.62■■■■□ 3.29
PMS1-220ENST00000618056 ITSN1Q15811 1721 aa35.62■■■■□ 3.29
PMS1-220ENST00000618056 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
PMS1-220ENST00000618056 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
PMS1-220ENST00000618056 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.61■■■■□ 3.29
PMS1-220ENST00000618056 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
PMS1-220ENST00000618056 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.58■■■■□ 3.29
PMS1-220ENST00000618056 ATP7BP35670 1465 aa35.57■■■■□ 3.29
PMS1-220ENST00000618056 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.56■■■■□ 3.28
PMS1-220ENST00000618056 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
PMS1-220ENST00000618056 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
PMS1-220ENST00000618056 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
PMS1-220ENST00000618056 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PMS1-220ENST00000618056 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.54■■■■□ 3.28
PMS1-220ENST00000618056 CDK19Q9BWU1 502 aa35.54■■■■□ 3.28
PMS1-220ENST00000618056 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.52■■■■□ 3.28
PMS1-220ENST00000618056 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.52■■■■□ 3.28
PMS1-220ENST00000618056 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
PMS1-220ENST00000618056 PSME1Q06323 249 aa35.51■■■■□ 3.28
PMS1-220ENST00000618056 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.51■■■■□ 3.27
PMS1-220ENST00000618056 SBNO1A3KN83 1393 aa35.49■■■■□ 3.27
PMS1-220ENST00000618056 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
PMS1-220ENST00000618056 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.47■■■■□ 3.27
PMS1-220ENST00000618056 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.45■■■■□ 3.27
PMS1-220ENST00000618056 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
PMS1-220ENST00000618056 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.43■■■■□ 3.26
PMS1-220ENST00000618056 POTEAQ6S8J7 498 aa35.42■■■■□ 3.26
PMS1-220ENST00000618056 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.42■■■■□ 3.26
PMS1-220ENST00000618056 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
PMS1-220ENST00000618056 ALS2Q96Q42 1657 aa35.4■■■■□ 3.26
PMS1-220ENST00000618056 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
PMS1-220ENST00000618056 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
PMS1-220ENST00000618056 ARHGEF10O15013 1369 aa35.39■■■■□ 3.26
PMS1-220ENST00000618056 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
PMS1-220ENST00000618056 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.38■■■■□ 3.25
PMS1-220ENST00000618056 EVC2Q86UK5 1308 aa35.38■■■■□ 3.25
PMS1-220ENST00000618056 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.37■■■■□ 3.25
PMS1-220ENST00000618056 ADAMTS2O95450 1211 aa35.37■■■■□ 3.25
PMS1-220ENST00000618056 C8orf37Q96NL8 207 aa35.36■■■■□ 3.25
PMS1-220ENST00000618056 CABP2Q9NPB3 220 aa35.35■■■■□ 3.25
PMS1-220ENST00000618056 AFF2P51816 1311 aa35.35■■■■□ 3.25
PMS1-220ENST00000618056 ABCA3Q99758 1704 aa35.34■■■■□ 3.25
PMS1-220ENST00000618056 SOCS7O14512 581 aa35.34■■■■□ 3.25
PMS1-220ENST00000618056 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.32■■■■□ 3.24
PMS1-220ENST00000618056 ACEP12821 1306 aa35.32■■■■□ 3.24
PMS1-220ENST00000618056 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
PMS1-220ENST00000618056 NGLY1Q96IV0 654 aa35.3■■■■□ 3.24
PMS1-220ENST00000618056 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.29■■■■□ 3.24
PMS1-220ENST00000618056 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
PMS1-220ENST00000618056 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.25■■■■□ 3.23
PMS1-220ENST00000618056 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
PMS1-220ENST00000618056 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.22■■■■□ 3.23
PMS1-220ENST00000618056 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.21■■■■□ 3.23
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