RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617806.4

BECN1-222, Transcript of beclin 1, human

TSL 5

Gene BECN1, Length 4,865 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BECN1-222	ENST00000617806	RABEP1	Q15276	862 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BECN1-222	ENST00000617806	MPND	Q8N594	471 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BECN1-222	ENST00000617806	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BECN1-222	ENST00000617806	STAC3	Q96MF2	364 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BECN1-222	ENST00000617806	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BECN1-222	ENST00000617806		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BECN1-222	ENST00000617806	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BECN1-222	ENST00000617806	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BECN1-222	ENST00000617806	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BECN1-222	ENST00000617806	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BECN1-222	ENST00000617806	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		13.58	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	HOMER1	Q86YM7	354 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	PRDM2	Q13029	1718 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	NPHP1	O15259	732 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	TPM3	P06753	285 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	DAPK1	P53355	1430 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	UQCRH	P07919	91 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	NCAPD3	P42695	1498 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	FIBP	O43427	364 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24	3e-9	■■■■□ 25.8
BECN1-222	ENST00000617806	MAPKBP1	O60336	1514 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	FOSB	P53539	338 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	SPC24	Q8NBT2	197 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.52	□□□□□ -0.24
BECN1-222	ENST00000617806	MCM2	P49736	904 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	TEF	Q10587	303 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	GPS2	Q13227	327 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	ERC2	O15083	957 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	MNS1	Q8NEH6	495 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	IGHD	P01880	384 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	ZMYND15	Q9H091	742 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	CPLX1	O14810	134 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	SYCE3	A1L190	88 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	TPM1	P09493	284 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BECN1-222	ENST00000617806	GNAI3	P08754	354 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BECN1-222	ENST00000617806	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26

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