RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 ORAI2Q96SN7 254 aa28.9■■■□□ 2.22
SGMS1-208ENST00000608287 KIF1BO60333 1816 aa28.9■■■□□ 2.22
SGMS1-208ENST00000608287 HFM1A2PYH4 1435 aa28.89■■■□□ 2.22
SGMS1-208ENST00000608287 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SGMS1-208ENST00000608287 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SGMS1-208ENST00000608287 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.87■■■□□ 2.21
SGMS1-208ENST00000608287 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
SGMS1-208ENST00000608287 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
SGMS1-208ENST00000608287 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
SGMS1-208ENST00000608287 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
SGMS1-208ENST00000608287 EP400Q96L91 3159 aa28.84■■■□□ 2.21
SGMS1-208ENST00000608287 CLTCL1P53675 1640 aa28.83■■■□□ 2.21
SGMS1-208ENST00000608287 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.83■■■□□ 2.21
SGMS1-208ENST00000608287 NAIPQ13075 1403 aa28.83■■■□□ 2.21
SGMS1-208ENST00000608287 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.81■■■□□ 2.2
SGMS1-208ENST00000608287 LRP5O75197 1615 aa28.8■■■□□ 2.2
SGMS1-208ENST00000608287 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.79■■■□□ 2.2
SGMS1-208ENST00000608287 PXDNQ92626 1479 aa28.78■■■□□ 2.2
SGMS1-208ENST00000608287 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.76■■■□□ 2.19
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SGMS1-208ENST00000608287 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.73■■■□□ 2.19
SGMS1-208ENST00000608287 SLIT2O94813 1529 aa28.71■■■□□ 2.19
SGMS1-208ENST00000608287 GLI3P10071 1580 aa28.71■■■□□ 2.19
SGMS1-208ENST00000608287 FOXO3O43524 673 aa28.7■■■□□ 2.18
SGMS1-208ENST00000608287 KIF1AQ12756 1690 aa28.66■■■□□ 2.18
SGMS1-208ENST00000608287 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.65■■■□□ 2.18
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.65■■■□□ 2.18
SGMS1-208ENST00000608287 USP32Q8NFA0 1604 aa28.65■■■□□ 2.18
SGMS1-208ENST00000608287 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.64■■■□□ 2.18
SGMS1-208ENST00000608287 PPLO60437 1756 aa28.63■■■□□ 2.17
SGMS1-208ENST00000608287 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
SGMS1-208ENST00000608287 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
SGMS1-208ENST00000608287 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.62■■■□□ 2.17
SGMS1-208ENST00000608287 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.61■■■□□ 2.17
SGMS1-208ENST00000608287 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.6■■■□□ 2.17
SGMS1-208ENST00000608287 BAG6P46379 1132 aa28.6■■■□□ 2.17
SGMS1-208ENST00000608287 VPS72Q15906 364 aa28.6■■■□□ 2.17
SGMS1-208ENST00000608287 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.58■■■□□ 2.17
SGMS1-208ENST00000608287 TECPR2O15040 1411 aa28.58■■■□□ 2.17
SGMS1-208ENST00000608287 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SGMS1-208ENST00000608287 PSME1Q06323 249 aa28.54■■■□□ 2.16
SGMS1-208ENST00000608287 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
SGMS1-208ENST00000608287 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.53■■■□□ 2.16
SGMS1-208ENST00000608287 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.52■■■□□ 2.16
SGMS1-208ENST00000608287 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.52■■■□□ 2.16
SGMS1-208ENST00000608287 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.52■■■□□ 2.16
SGMS1-208ENST00000608287 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.51■■■□□ 2.15
SGMS1-208ENST00000608287 NUTM2FA1L443 756 aa28.5■■■□□ 2.15
SGMS1-208ENST00000608287 HRCP23327 699 aa28.5■■■□□ 2.15
SGMS1-208ENST00000608287 ABCC11Q96J66 1382 aa28.5■■■□□ 2.15
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGEF10O15013 1369 aa28.49■■■□□ 2.15
SGMS1-208ENST00000608287 A0A0G2JS52 829 aa28.48■■■□□ 2.15
SGMS1-208ENST00000608287 MYT1Q01538 1121 aa28.48■■■□□ 2.15
SGMS1-208ENST00000608287 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SGMS1-208ENST00000608287 STK26Q9P289 416 aa28.46■■■□□ 2.15
SGMS1-208ENST00000608287 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.46■■■□□ 2.15
SGMS1-208ENST00000608287 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.45■■■□□ 2.14
SGMS1-208ENST00000608287 SBNO1A3KN83 1393 aa28.45■■■□□ 2.14
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.45■■■□□ 2.14
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SGMS1-208ENST00000608287 ABCA3Q99758 1704 aa28.42■■■□□ 2.14
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SGMS1-208ENST00000608287 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.4■■■□□ 2.14
SGMS1-208ENST00000608287 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.39■■■□□ 2.14
SGMS1-208ENST00000608287 SIRT1Q96EB6 747 aa28.39■■■□□ 2.14
SGMS1-208ENST00000608287 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.38■■■□□ 2.13
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SGMS1-208ENST00000608287 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.37■■■□□ 2.13
SGMS1-208ENST00000608287 DISP2A7MBM2 1401 aa28.36■■■□□ 2.13
SGMS1-208ENST00000608287 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
SGMS1-208ENST00000608287 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.36■■■□□ 2.13
SGMS1-208ENST00000608287 ADGRB2O60241 1585 aa28.34■■■□□ 2.13
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SGMS1-208ENST00000608287 NRAPQ86VF7 1730 aa28.34■■■□□ 2.13
SGMS1-208ENST00000608287 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
SGMS1-208ENST00000608287 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
SGMS1-208ENST00000608287 PIK3C2GO75747 1445 aa28.33■■■□□ 2.13
SGMS1-208ENST00000608287 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
SGMS1-208ENST00000608287 FAM83GA6ND36 823 aa28.31■■■□□ 2.12
SGMS1-208ENST00000608287 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.3■■■□□ 2.12
SGMS1-208ENST00000608287 PLEKHG5O94827 1062 aa28.29■■■□□ 2.12
SGMS1-208ENST00000608287 BTG4Q9NY30 223 aa28.29■■■□□ 2.12
SGMS1-208ENST00000608287 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.28■■■□□ 2.12
SGMS1-208ENST00000608287 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.28■■■□□ 2.12
SGMS1-208ENST00000608287 RGL3Q3MIN7 710 aa28.28■■■□□ 2.12
SGMS1-208ENST00000608287 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.27■■■□□ 2.12
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SGMS1-208ENST00000608287 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SGMS1-208ENST00000608287 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.24■■■□□ 2.11
SGMS1-208ENST00000608287 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.23■■■□□ 2.11
SGMS1-208ENST00000608287 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.23■■■□□ 2.11
SGMS1-208ENST00000608287 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SGMS1-208ENST00000608287 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.23■■■□□ 2.11
SGMS1-208ENST00000608287 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.21■■■□□ 2.11
SGMS1-208ENST00000608287 YY1P25490 414 aa28.21■■■□□ 2.11
SGMS1-208ENST00000608287 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.2■■■□□ 2.1
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