RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598539.5

FCHO1-225, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-225ENST00000598539 ITGAEP38570 1179 aa19.42■□□□□ 0.7
FCHO1-225ENST00000598539 PRAG1Q86YV5 1406 aa19.41■□□□□ 0.7
FCHO1-225ENST00000598539 KIF1BO60333 1816 aa19.4■□□□□ 0.7
FCHO1-225ENST00000598539 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.4■□□□□ 0.7
FCHO1-225ENST00000598539 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
FCHO1-225ENST00000598539 ESCO1Q5FWF5 840 aa19.39■□□□□ 0.69
FCHO1-225ENST00000598539 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
FCHO1-225ENST00000598539 MYOM2P54296 1465 aa19.39■□□□□ 0.69
FCHO1-225ENST00000598539 CLTCL1P53675 1640 aa19.38■□□□□ 0.69
FCHO1-225ENST00000598539 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa19.38■□□□□ 0.69
FCHO1-225ENST00000598539 BCL9LQ86UU0 1499 aa19.36■□□□□ 0.69
FCHO1-225ENST00000598539 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
FCHO1-225ENST00000598539 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa19.35■□□□□ 0.69
FCHO1-225ENST00000598539 EP400Q96L91 3159 aa19.33■□□□□ 0.69
FCHO1-225ENST00000598539 UNC5CLQ8IV45 518 aa19.33■□□□□ 0.68
FCHO1-225ENST00000598539 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
FCHO1-225ENST00000598539 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
FCHO1-225ENST00000598539 PXDNQ92626 1479 aa19.31■□□□□ 0.68
FCHO1-225ENST00000598539 FOXO3O43524 673 aa19.31■□□□□ 0.68
FCHO1-225ENST00000598539 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
FCHO1-225ENST00000598539 RALGAPBQ86X10 1494 aa19.28■□□□□ 0.68
FCHO1-225ENST00000598539 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.27■□□□□ 0.68
FCHO1-225ENST00000598539 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
FCHO1-225ENST00000598539 NAIPQ13075 1403 aa19.25■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 SLIT2O94813 1529 aa19.25■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa19.24■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 KIF1AQ12756 1690 aa19.23■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 LRP5O75197 1615 aa19.22■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 PPLO60437 1756 aa19.22■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 PSME1Q06323 249 aa19.22■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 DEFB132Q7Z7B7 95 aa19.22■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 SEPT12Q8IYM1 358 aa19.22■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 GLI3P10071 1580 aa19.22■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 USP32Q8NFA0 1604 aa19.22■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 NUTM2FA1L443 756 aa19.21■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 TECPR2O15040 1411 aa19.21■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 BAG6P46379 1132 aa19.21■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 VPS72Q15906 364 aa19.21■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
FCHO1-225ENST00000598539 KRT27Q7Z3Y8 459 aa19.2■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 STK26Q9P289 416 aa19.2■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 A0A0G2JS52 829 aa19.19■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 MYT1Q01538 1121 aa19.19■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 KRT28Q7Z3Y7 464 aa19.19■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 ABCC11Q96J66 1382 aa19.18■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.18■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 TNS3Q68CZ2 1445 aa19.17■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.17■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 ARHGEF10O15013 1369 aa19.17■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 NWD2Q9ULI1 1742 aa19.16■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 BRWD3Q6RI45 1802 aa19.15■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 FMN2Q9NZ56 1722 aa19.14■□□□□ 0.66
FCHO1-225ENST00000598539 PHF8Q9UPP1 1060 aa19.14■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.14■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.13■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa19.13■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 SBNO1A3KN83 1393 aa19.13■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 SIRT1Q96EB6 747 aa19.11■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 PLCH1Q4KWH8 1693 aa19.11■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 HRCP23327 699 aa19.1■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 RGL3Q3MIN7 710 aa19.1■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.08■□□□□ 0.65
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM132EQ6IEE7 984 aa19.08■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 CABLES1Q8TDN4 633 aa19.08■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 PLEKHG5O94827 1062 aa19.07■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.07■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 PIK3C2GO75747 1445 aa19.07■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 IFT172Q9UG01 1749 aa19.05■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 FAM83GA6ND36 823 aa19.04■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 RGPD1P0DJD0 1748 aa19.04■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.04■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 ANKARQ7Z5J8 1434 aa19.03■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 BTG4Q9NY30 223 aa19.03■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 GPRASP1Q5JY77 1395 aa19.03■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 ABCA3Q99758 1704 aa19.03■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
FCHO1-225ENST00000598539 DISP2A7MBM2 1401 aa19.01■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 ADGRB2O60241 1585 aa19.01■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 POGKQ9P215 609 aa19■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 PARD3Q8TEW0 1356 aa18.98■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.98■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 PRAM1Q96QH2 718 aa18.98■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 NRAPQ86VF7 1730 aa18.97■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.97■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa18.97■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa18.97■□□□□ 0.63
FCHO1-225ENST00000598539 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms