RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 RUNDC1Q96C34 613 aa9.88□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 CFAP44Q96MT7 982 aa9.88□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCC11Q96J66 1382 aa9.88□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 SHPRHQ149N8 1683 aa9.87□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 ADGRB2O60241 1585 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 PPLO60437 1756 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF428Q96B54 188 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 MED14O60244 1454 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF16BQ96L93 1317 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-202ENST00000586851 IL16Q14005 1332 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 APAF1O14727 1248 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 WWC1Q8IX03 1113 aa9.83□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 NLRP1Q9C000 1473 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 RGS3P49796 1198 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFYVE9O95405 1425 aa9.81□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 ADGRB1O14514 1584 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 MORC1Q86VD1 984 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 MROH2AA6NES4 1674 aa9.8□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.79□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 IL27Q8NEV9 243 aa9.79□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 CHMP5Q9NZZ3 219 aa9.79□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 ASXL2Q76L83 1435 aa9.79□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 USP19O94966 1318 aa9.79□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 EVC2Q86UK5 1308 aa9.79□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.79□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 PIK3C2BO00750 1634 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.78□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.77□□□□□ -0.85
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CAPNS1-202ENST00000586851 UGGT1Q9NYU2 1555 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHDP01880 384 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 MRE11P49959 708 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 SNX21Q969T3 373 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.75□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 NOS1P29475 1434 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF3BO15066 747 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 HSCBQ8IWL3 235 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 COG6Q9Y2V7 657 aa9.74□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 FSD2A1L4K1 749 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 MCM4P33991 863 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.73□□□□□ -0.85
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CAPNS1-202ENST00000586851 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.73□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCC3O15438 1527 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-202ENST00000586851 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.72□□□□□ -0.85
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