RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584374.1

ITGB4-211, Transcript of integrin subunit beta 4, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB4, Length 950 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4-211ENST00000584374 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.64■■□□□ 1.54
ITGB4-211ENST00000584374 STAC3Q96MF2 364 aa24.63■■□□□ 1.53
ITGB4-211ENST00000584374 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.63■■□□□ 1.53
ITGB4-211ENST00000584374 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.62■■□□□ 1.53
ITGB4-211ENST00000584374 SIRT1Q96EB6 747 aa24.62■■□□□ 1.53
ITGB4-211ENST00000584374 DLC1Q96QB1 1528 aa24.61■■□□□ 1.53
ITGB4-211ENST00000584374 JCADQ9P266 1359 aa24.6■■□□□ 1.53
ITGB4-211ENST00000584374 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ITGB4-211ENST00000584374 ORAI2Q96SN7 254 aa24.56■■□□□ 1.52
ITGB4-211ENST00000584374 SHPRHQ149N8 1683 aa24.54■■□□□ 1.52
ITGB4-211ENST00000584374 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.53■■□□□ 1.52
ITGB4-211ENST00000584374 PRAM1Q96QH2 718 aa24.53■■□□□ 1.52
ITGB4-211ENST00000584374 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.53■■□□□ 1.52
ITGB4-211ENST00000584374 LRP6O75581 1613 aa24.52■■□□□ 1.52
ITGB4-211ENST00000584374 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
ITGB4-211ENST00000584374 ADGRB2O60241 1585 aa24.5■■□□□ 1.51
ITGB4-211ENST00000584374 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.49■■□□□ 1.51
ITGB4-211ENST00000584374 NEUROD1Q13562 356 aa24.49■■□□□ 1.51
ITGB4-211ENST00000584374 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.49■■□□□ 1.51
ITGB4-211ENST00000584374 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
ITGB4-211ENST00000584374 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.47■■□□□ 1.51
ITGB4-211ENST00000584374 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
ITGB4-211ENST00000584374 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.47■■□□□ 1.51
ITGB4-211ENST00000584374 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
ITGB4-211ENST00000584374 NUTM2FA1L443 756 aa24.46■■□□□ 1.51
ITGB4-211ENST00000584374 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
ITGB4-211ENST00000584374 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.45■■□□□ 1.5
ITGB4-211ENST00000584374 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.45■■□□□ 1.5
ITGB4-211ENST00000584374 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
ITGB4-211ENST00000584374 PXDNQ92626 1479 aa24.44■■□□□ 1.5
ITGB4-211ENST00000584374 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.43■■□□□ 1.5
ITGB4-211ENST00000584374 POGKQ9P215 609 aa24.43■■□□□ 1.5
ITGB4-211ENST00000584374 USP32Q8NFA0 1604 aa24.43■■□□□ 1.5
ITGB4-211ENST00000584374 TONSLQ96HA7 1378 aa24.42■■□□□ 1.5
ITGB4-211ENST00000584374 KIF1AQ12756 1690 aa24.39■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.38■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.38■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 FOXO3O43524 673 aa24.38■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.35■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.35■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 POTEAQ6S8J7 498 aa24.35■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.35■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.34■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
ITGB4-211ENST00000584374 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
ITGB4-211ENST00000584374 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
ITGB4-211ENST00000584374 SOCS7O14512 581 aa24.32■■□□□ 1.48
ITGB4-211ENST00000584374 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
ITGB4-211ENST00000584374 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.32■■□□□ 1.48
ITGB4-211ENST00000584374 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
ITGB4-211ENST00000584374 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.29■■□□□ 1.48
ITGB4-211ENST00000584374 ATP7BP35670 1465 aa24.29■■□□□ 1.48
ITGB4-211ENST00000584374 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ITGB4-211ENST00000584374 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ITGB4-211ENST00000584374 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.27■■□□□ 1.48
ITGB4-211ENST00000584374 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.25■■□□□ 1.47
ITGB4-211ENST00000584374 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.25■■□□□ 1.47
ITGB4-211ENST00000584374 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.25■■□□□ 1.47
ITGB4-211ENST00000584374 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
ITGB4-211ENST00000584374 SBNO1A3KN83 1393 aa24.23■■□□□ 1.47
ITGB4-211ENST00000584374 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ITGB4-211ENST00000584374 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.23■■□□□ 1.47
ITGB4-211ENST00000584374 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.22■■□□□ 1.47
ITGB4-211ENST00000584374 CDK19Q9BWU1 502 aa24.22■■□□□ 1.47
ITGB4-211ENST00000584374 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ITGB4-211ENST00000584374 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.21■■□□□ 1.47
ITGB4-211ENST00000584374 AFF2P51816 1311 aa24.21■■□□□ 1.47
ITGB4-211ENST00000584374 ADAMTS2O95450 1211 aa24.2■■□□□ 1.46
ITGB4-211ENST00000584374 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ITGB4-211ENST00000584374 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ITGB4-211ENST00000584374 C8orf37Q96NL8 207 aa24.19■■□□□ 1.46
ITGB4-211ENST00000584374 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.19■■□□□ 1.46
ITGB4-211ENST00000584374 ITSN1Q15811 1721 aa24.18■■□□□ 1.46
ITGB4-211ENST00000584374 PSME1Q06323 249 aa24.17■■□□□ 1.46
ITGB4-211ENST00000584374 ALS2Q96Q42 1657 aa24.15■■□□□ 1.46
ITGB4-211ENST00000584374 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
ITGB4-211ENST00000584374 ABCA3Q99758 1704 aa24.13■■□□□ 1.45
ITGB4-211ENST00000584374 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
ITGB4-211ENST00000584374 ARHGEF10O15013 1369 aa24.13■■□□□ 1.45
ITGB4-211ENST00000584374 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
ITGB4-211ENST00000584374 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.12■■□□□ 1.45
ITGB4-211ENST00000584374 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.11■■□□□ 1.45
ITGB4-211ENST00000584374 NGLY1Q96IV0 654 aa24.11■■□□□ 1.45
ITGB4-211ENST00000584374 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ITGB4-211ENST00000584374 CABP2Q9NPB3 220 aa24.1■■□□□ 1.45
ITGB4-211ENST00000584374 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.09■■□□□ 1.45
ITGB4-211ENST00000584374 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.09■■□□□ 1.45
ITGB4-211ENST00000584374 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
ITGB4-211ENST00000584374 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.08■■□□□ 1.44
ITGB4-211ENST00000584374 ACEP12821 1306 aa24.08■■□□□ 1.44
ITGB4-211ENST00000584374 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.07■■□□□ 1.44
ITGB4-211ENST00000584374 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.07■■□□□ 1.44
ITGB4-211ENST00000584374 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.06■■□□□ 1.44
ITGB4-211ENST00000584374 SLIT2O94813 1529 aa24.06■■□□□ 1.44
ITGB4-211ENST00000584374 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.8 ms