RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576380.5

P4HB-222, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 3

Gene P4HB, Length 943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-222	ENST00000576380	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	29.38	■■■□□ 2.29
P4HB-222	ENST00000576380	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	29.37	■■■□□ 2.29
P4HB-222	ENST00000576380	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
P4HB-222	ENST00000576380	SOCS7	O14512	581 aa		29.33	■■■□□ 2.29
P4HB-222	ENST00000576380	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	PRAM1	Q96QH2	718 aa		29.32	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		29.31	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	ADGRB1	O14514	1584 aa		29.31	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		29.3	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		29.3	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		29.3	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		29.29	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		29.29	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	POGK	Q9P215	609 aa		29.29	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	NUTM2F	A1L443	756 aa		29.28	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	DLC1	Q96QB1	1528 aa		29.27	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	29.27	■■■□□ 2.28
P4HB-222	ENST00000576380	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
P4HB-222	ENST00000576380	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		29.24	■■■□□ 2.27
P4HB-222	ENST00000576380	SHPRH	Q149N8	1683 aa		29.24	■■■□□ 2.27
P4HB-222	ENST00000576380	NEUROD1	Q13562	356 aa		29.22	■■■□□ 2.27
P4HB-222	ENST00000576380	FOXO3	O43524	673 aa		29.2	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		29.2	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		29.18	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		29.18	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	LRP6	O75581	1613 aa		29.17	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		29.16	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		29.15	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	POTEA	Q6S8J7	498 aa		29.15	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
P4HB-222	ENST00000576380	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.25
P4HB-222	ENST00000576380	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
P4HB-222	ENST00000576380	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		29.11	■■■□□ 2.25
P4HB-222	ENST00000576380	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
P4HB-222	ENST00000576380	PXDN	Q92626	1479 aa		29.09	■■■□□ 2.25
P4HB-222	ENST00000576380	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		29.08	■■■□□ 2.25
P4HB-222	ENST00000576380	ADGRB2	O60241	1585 aa		29.07	■■■□□ 2.24
P4HB-222	ENST00000576380	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
P4HB-222	ENST00000576380	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		29.05	■■■□□ 2.24
P4HB-222	ENST00000576380	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
P4HB-222	ENST00000576380	KIF1A	Q12756	1690 aa		29.04	■■■□□ 2.24
P4HB-222	ENST00000576380	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		29.03	■■■□□ 2.24
P4HB-222	ENST00000576380	USP32	Q8NFA0	1604 aa		29.02	■■■□□ 2.24
P4HB-222	ENST00000576380	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		29.02	■■■□□ 2.24
P4HB-222	ENST00000576380	PSME1	Q06323	249 aa		29.02	■■■□□ 2.24
P4HB-222	ENST00000576380	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		29.01	■■■□□ 2.23
P4HB-222	ENST00000576380	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
P4HB-222	ENST00000576380	ADAMTS2	O95450	1211 aa		29	■■■□□ 2.23
P4HB-222	ENST00000576380	CDK19	Q9BWU1	502 aa		28.99	■■■□□ 2.23
P4HB-222	ENST00000576380	C8orf37	Q96NL8	207 aa		28.98	■■■□□ 2.23
P4HB-222	ENST00000576380	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
P4HB-222	ENST00000576380	AFF2	P51816	1311 aa		28.97	■■■□□ 2.23
P4HB-222	ENST00000576380	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		28.97	■■■□□ 2.23
P4HB-222	ENST00000576380	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
P4HB-222	ENST00000576380	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		28.96	■■■□□ 2.23
P4HB-222	ENST00000576380	NGLY1	Q96IV0	654 aa		28.96	■■■□□ 2.23
P4HB-222	ENST00000576380	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		28.94	■■■□□ 2.22
P4HB-222	ENST00000576380	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
P4HB-222	ENST00000576380	SBNO1	A3KN83	1393 aa		28.92	■■■□□ 2.22
P4HB-222	ENST00000576380	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
P4HB-222	ENST00000576380	TONSL	Q96HA7	1378 aa		28.89	■■■□□ 2.22
P4HB-222	ENST00000576380	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
P4HB-222	ENST00000576380	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		28.89	■■■□□ 2.22
P4HB-222	ENST00000576380	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
P4HB-222	ENST00000576380	RXRB	P28702	533 aa		28.88	■■■□□ 2.21
P4HB-222	ENST00000576380	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
P4HB-222	ENST00000576380	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		28.88	■■■□□ 2.21
P4HB-222	ENST00000576380	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		28.86	■■■□□ 2.21
P4HB-222	ENST00000576380	ATP7B	P35670	1465 aa		28.86	■■■□□ 2.21
P4HB-222	ENST00000576380	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		28.86	■■■□□ 2.21
P4HB-222	ENST00000576380	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		28.84	■■■□□ 2.21
P4HB-222	ENST00000576380	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		28.84	■■■□□ 2.21
P4HB-222	ENST00000576380	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		28.83	■■■□□ 2.21
P4HB-222	ENST00000576380	USP21	Q9UK80	565 aa		28.83	■■■□□ 2.21
P4HB-222	ENST00000576380	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	ARHGEF10	O15013	1369 aa		28.82	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	ITSN1	Q15811	1721 aa		28.81	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	CABP2	Q9NPB3	220 aa		28.81	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		28.8	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	ACE	P12821	1306 aa		28.79	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	PLEKHG5	O94827	1062 aa		28.78	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		28.78	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
P4HB-222	ENST00000576380	EVC2	Q86UK5	1308 aa		28.76	■■■□□ 2.19
P4HB-222	ENST00000576380	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
P4HB-222	ENST00000576380	ALS2	Q96Q42	1657 aa		28.74	■■■□□ 2.19
P4HB-222	ENST00000576380	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		28.74	■■■□□ 2.19
P4HB-222	ENST00000576380	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		28.73	■■■□□ 2.19
P4HB-222	ENST00000576380	CABP1	Q9NZU7	370 aa		28.72	■■■□□ 2.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms