RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 POGKQ9P215 609 aa29.96■■■□□ 2.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.95■■■□□ 2.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.95■■■□□ 2.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCCP43146 1447 aa29.93■■■□□ 2.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLAIN2Q9P270 581 aa29.93■■■□□ 2.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.88■■■□□ 2.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 MST1RQ04912 1400 aa29.86■■■□□ 2.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.86■■■□□ 2.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.85■■■□□ 2.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.84■■■□□ 2.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.83■■■□□ 2.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUTM2FA1L443 756 aa29.8■■■□□ 2.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.79■■■□□ 2.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.78■■■□□ 2.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADGRB2O60241 1585 aa29.78■■■□□ 2.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSPA1LP34931 641 aa29.77■■■□□ 2.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.76■■■□□ 2.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 BRINP3Q76B58 766 aa29.76■■■□□ 2.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 ORAI2Q96SN7 254 aa29.73■■■□□ 2.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.69■■■□□ 2.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 PHLPP1O60346 1717 aa29.67■■■□□ 2.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP32Q8NFA0 1604 aa29.67■■■□□ 2.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDK19Q9BWU1 502 aa29.66■■■□□ 2.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
CCNDBP1-208ENST00000566515 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.63■■■□□ 2.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.63■■■□□ 2.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.63■■■□□ 2.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.63■■■□□ 2.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP47Q96K76 1375 aa29.6■■■□□ 2.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.6■■■□□ 2.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
CCNDBP1-208ENST00000566515 CABP2Q9NPB3 220 aa29.57■■■□□ 2.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.57■■■□□ 2.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOXO3O43524 673 aa29.56■■■□□ 2.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP7BP35670 1465 aa29.56■■■□□ 2.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF1AQ12756 1690 aa29.56■■■□□ 2.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 EVC2Q86UK5 1308 aa29.56■■■□□ 2.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.55■■■□□ 2.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.55■■■□□ 2.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 ITSN1Q15811 1721 aa29.54■■■□□ 2.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.51■■■□□ 2.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 TESK2Q96S53 571 aa29.51■■■□□ 2.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.5■■■□□ 2.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.49■■■□□ 2.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 PXDNQ92626 1479 aa29.47■■■□□ 2.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.45■■■□□ 2.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.44■■■□□ 2.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSME1Q06323 249 aa29.44■■■□□ 2.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 JCADQ9P266 1359 aa29.44■■■□□ 2.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.41■■■□□ 2.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 CABP1Q9NZU7 370 aa29.41■■■□□ 2.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 SHPRHQ149N8 1683 aa29.4■■■□□ 2.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACEP12821 1306 aa29.4■■■□□ 2.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC24A1O60721 1099 aa29.39■■■□□ 2.3
CCNDBP1-208ENST00000566515 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.39■■■□□ 2.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.38■■■□□ 2.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMF1P82094 1093 aa29.37■■■□□ 2.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.36■■■□□ 2.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.34■■■□□ 2.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 SBNO1A3KN83 1393 aa29.32■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMC1Q8TDI8 760 aa29.31■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.31■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.3■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.3■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.28■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 AKAP12Q02952 1782 aa29.27■■■□□ 2.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALS2Q96Q42 1657 aa29.26■■■□□ 2.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRP6O75581 1613 aa29.25■■■□□ 2.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDCA8Q53HL2 280 aa29.25■■■□□ 2.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLEKHG5O94827 1062 aa29.24■■■□□ 2.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP6P35125 1406 aa29.24■■■□□ 2.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGEF10O15013 1369 aa29.23■■■□□ 2.27
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
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