RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa44.68■■■■■ 4.74
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CMTM4-204ENST00000563952 NHSL1Q5SYE7 1610 aa44.64■■■■■ 4.74
CMTM4-204ENST00000563952 SIRT1Q96EB6 747 aa44.63■■■■■ 4.74
CMTM4-204ENST00000563952 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
CMTM4-204ENST00000563952 ORAI2Q96SN7 254 aa44.59■■■■■ 4.73
CMTM4-204ENST00000563952 PRAM1Q96QH2 718 aa44.57■■■■■ 4.73
CMTM4-204ENST00000563952 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP44.56■■■■■ 4.72
CMTM4-204ENST00000563952 DLC1Q96QB1 1528 aa44.55■■■■■ 4.72
CMTM4-204ENST00000563952 TRAK1Q9UPV9 953 aa44.54■■■■■ 4.72
CMTM4-204ENST00000563952 NUTM2FA1L443 756 aa44.53■■■■■ 4.72
CMTM4-204ENST00000563952 SIN3AQ96ST3 1273 aa44.53■■■■■ 4.72
CMTM4-204ENST00000563952 POGKQ9P215 609 aa44.53■■■■■ 4.72
CMTM4-204ENST00000563952 SHPRHQ149N8 1683 aa44.51■■■■■ 4.72
CMTM4-204ENST00000563952 ESCO1Q5FWF5 840 aa44.5■■■■■ 4.71
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CMTM4-204ENST00000563952 NEUROD1Q13562 356 aa44.47■■■■■ 4.71
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CMTM4-204ENST00000563952 LRP6O75581 1613 aa44.39■■■■■ 4.7
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CMTM4-204ENST00000563952 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
CMTM4-204ENST00000563952 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
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CMTM4-204ENST00000563952 NPHP3Q7Z494 1330 aa44.33■■■■■ 4.69
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CMTM4-204ENST00000563952 ADGRB2O60241 1585 aa44.32■■■■■ 4.69
CMTM4-204ENST00000563952 FOXO3O43524 673 aa44.32■■■■■ 4.69
CMTM4-204ENST00000563952 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.69
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CMTM4-204ENST00000563952 PHF8Q9UPP1 1060 aa44.21■■■■■ 4.67
CMTM4-204ENST00000563952 USP32Q8NFA0 1604 aa44.21■■■■■ 4.67
CMTM4-204ENST00000563952 ANKARQ7Z5J8 1434 aa44.2■■■■■ 4.67
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CMTM4-204ENST00000563952 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa44.13■■■■■ 4.66
CMTM4-204ENST00000563952 KRT28Q7Z3Y7 464 aa44.11■■■■■ 4.65
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CMTM4-204ENST00000563952 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
CMTM4-204ENST00000563952 PRR36Q9H6K5 1346 aa44.09■■■■■ 4.65
CMTM4-204ENST00000563952 TONSLQ96HA7 1378 aa44.07■■■■■ 4.65
CMTM4-204ENST00000563952 ADAMTS2O95450 1211 aa44.07■■■■■ 4.65
CMTM4-204ENST00000563952 C8orf37Q96NL8 207 aa44.05■■■■■ 4.64
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CMTM4-204ENST00000563952 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa44.02■■■■■ 4.64
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CMTM4-204ENST00000563952 CDK19Q9BWU1 502 aa44.01■■■■■ 4.64
CMTM4-204ENST00000563952 AFF2P51816 1311 aa44■■■■■ 4.63
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CMTM4-204ENST00000563952 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
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CMTM4-204ENST00000563952 ACEP12821 1306 aa43.73■■■■■ 4.59
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CMTM4-204ENST00000563952 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa43.72■■■■■ 4.59
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CMTM4-204ENST00000563952 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
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