RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.32■■□□□ 1.96
USP10-208ENST00000563386 ADGRB1O14514 1584 aa27.31■■□□□ 1.96
USP10-208ENST00000563386 NUTM2FA1L443 756 aa27.31■■□□□ 1.96
USP10-208ENST00000563386 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.31■■□□□ 1.96
USP10-208ENST00000563386 SIRT1Q96EB6 747 aa27.31■■□□□ 1.96
USP10-208ENST00000563386 ORAI2Q96SN7 254 aa27.3■■□□□ 1.96
USP10-208ENST00000563386 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
USP10-208ENST00000563386 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
USP10-208ENST00000563386 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
USP10-208ENST00000563386 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.28■■□□□ 1.96
USP10-208ENST00000563386 JCADQ9P266 1359 aa27.25■■□□□ 1.95
USP10-208ENST00000563386 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.25■■□□□ 1.95
USP10-208ENST00000563386 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
USP10-208ENST00000563386 DLC1Q96QB1 1528 aa27.25■■□□□ 1.95
USP10-208ENST00000563386 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.23■■□□□ 1.95
USP10-208ENST00000563386 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.21■■□□□ 1.95
USP10-208ENST00000563386 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.21■■□□□ 1.95
USP10-208ENST00000563386 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
USP10-208ENST00000563386 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
USP10-208ENST00000563386 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.19■■□□□ 1.94
USP10-208ENST00000563386 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.19■■□□□ 1.94
USP10-208ENST00000563386 ILDR2Q71H61 639 aa27.16■■□□□ 1.94
USP10-208ENST00000563386 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
USP10-208ENST00000563386 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 FOXO3O43524 673 aa27.13■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 TONSLQ96HA7 1378 aa27.12■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 SHPRHQ149N8 1683 aa27.11■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.11■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.11■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 ADGRB2O60241 1585 aa27.09■■□□□ 1.93
USP10-208ENST00000563386 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.07■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.06■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.06■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.06■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 LRP6O75581 1613 aa27.05■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.04■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 KIF1AQ12756 1690 aa27.04■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 USP32Q8NFA0 1604 aa27.02■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 PXDNQ92626 1479 aa27.02■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.02■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 SOCS7O14512 581 aa27.02■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
USP10-208ENST00000563386 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.01■■□□□ 1.91
USP10-208ENST00000563386 PRR36Q9H6K5 1346 aa27■■□□□ 1.91
USP10-208ENST00000563386 CDK19Q9BWU1 502 aa27■■□□□ 1.91
USP10-208ENST00000563386 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.99■■□□□ 1.91
USP10-208ENST00000563386 PSME1Q06323 249 aa26.98■■□□□ 1.91
USP10-208ENST00000563386 ADAMTS2O95450 1211 aa26.96■■□□□ 1.91
USP10-208ENST00000563386 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
USP10-208ENST00000563386 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.94■■□□□ 1.9
USP10-208ENST00000563386 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.94■■□□□ 1.9
USP10-208ENST00000563386 PLEKHG5O94827 1062 aa26.93■■□□□ 1.9
USP10-208ENST00000563386 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
USP10-208ENST00000563386 POTEAQ6S8J7 498 aa26.93■■□□□ 1.9
USP10-208ENST00000563386 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
USP10-208ENST00000563386 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.93■■□□□ 1.9
USP10-208ENST00000563386 C8orf37Q96NL8 207 aa26.92■■□□□ 1.9
USP10-208ENST00000563386 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.91■■□□□ 1.9
USP10-208ENST00000563386 ATP7BP35670 1465 aa26.9■■□□□ 1.9
USP10-208ENST00000563386 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.89■■□□□ 1.9
USP10-208ENST00000563386 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
USP10-208ENST00000563386 CABP2Q9NPB3 220 aa26.89■■□□□ 1.9
USP10-208ENST00000563386 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
USP10-208ENST00000563386 AFF2P51816 1311 aa26.88■■□□□ 1.89
USP10-208ENST00000563386 ITSN1Q15811 1721 aa26.87■■□□□ 1.89
USP10-208ENST00000563386 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.87■■□□□ 1.89
USP10-208ENST00000563386 NGLY1Q96IV0 654 aa26.87■■□□□ 1.89
USP10-208ENST00000563386 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.86■■□□□ 1.89
USP10-208ENST00000563386 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
USP10-208ENST00000563386 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.85■■□□□ 1.89
USP10-208ENST00000563386 SBNO1A3KN83 1393 aa26.84■■□□□ 1.89
USP10-208ENST00000563386 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
USP10-208ENST00000563386 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
USP10-208ENST00000563386 EVC2Q86UK5 1308 aa26.83■■□□□ 1.89
USP10-208ENST00000563386 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.83■■□□□ 1.89
USP10-208ENST00000563386 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.82■■□□□ 1.88
USP10-208ENST00000563386 ACEP12821 1306 aa26.81■■□□□ 1.88
USP10-208ENST00000563386 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.8■■□□□ 1.88
USP10-208ENST00000563386 ARHGEF10O15013 1369 aa26.8■■□□□ 1.88
USP10-208ENST00000563386 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.79■■□□□ 1.88
USP10-208ENST00000563386 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
USP10-208ENST00000563386 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.77■■□□□ 1.88
USP10-208ENST00000563386 CABP1Q9NZU7 370 aa26.76■■□□□ 1.87
USP10-208ENST00000563386 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
USP10-208ENST00000563386 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
USP10-208ENST00000563386 USP21Q9UK80 565 aa26.74■■□□□ 1.87
USP10-208ENST00000563386 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.74■■□□□ 1.87
USP10-208ENST00000563386 RXRBP28702 533 aa26.72■■□□□ 1.87
USP10-208ENST00000563386 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms