RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560851.2

TMC3-AS1-204, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TMC3-AS1, Length 1,269 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.67■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.67■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.67■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ORAI2Q96SN7 254 aa20.66■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-204ENST00000560851 STAC3Q96MF2 364 aa20.65■□□□□ 0.9
TMC3-AS1-204ENST00000560851 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SHPRHQ149N8 1683 aa20.64■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NUTM2FA1L443 756 aa20.63■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.63■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SIRT1Q96EB6 747 aa20.63■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 LRP6O75581 1613 aa20.61■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PRAM1Q96QH2 718 aa20.61■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 POGKQ9P215 609 aa20.61■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.59■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ADGRB1O14514 1584 aa20.59■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 DLC1Q96QB1 1528 aa20.58■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 MSH5O43196 834 aa20.58■□□□□ 0.89
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.57■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.56■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-204ENST00000560851 POTEAQ6S8J7 498 aa20.56■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-204ENST00000560851 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.56■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ADRA2BP18089 450 aa20.55■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-204ENST00000560851 FOXO3O43524 673 aa20.54■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-204ENST00000560851 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
TMC3-AS1-204ENST00000560851 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-204ENST00000560851 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.49■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PXDNQ92626 1479 aa20.49■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-204ENST00000560851 KIF1AQ12756 1690 aa20.48■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NEUROD1Q13562 356 aa20.48■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.48■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ADGRB2O60241 1585 aa20.47■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-204ENST00000560851 C8orf37Q96NL8 207 aa20.47■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ADAMTS2O95450 1211 aa20.46■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-204ENST00000560851 AFF2P51816 1311 aa20.46■□□□□ 0.87
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.45■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.45■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.45■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.44■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.43■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.42■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NGLY1Q96IV0 654 aa20.42■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PSME1Q06323 249 aa20.41■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 USP32Q8NFA0 1604 aa20.41■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.4■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.4■□□□□ 0.86
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.39■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 RXRBP28702 533 aa20.38■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.37■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.37■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SBNO1A3KN83 1393 aa20.35■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.34■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PLEKHG5O94827 1062 aa20.34■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CDK19Q9BWU1 502 aa20.34■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 USP21Q9UK80 565 aa20.34■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ATP7BP35670 1465 aa20.32■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ARHGEF10O15013 1369 aa20.32■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.31■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TONSLQ96HA7 1378 aa20.3■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ITSN1Q15811 1721 aa20.3■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.29■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.27■□□□□ 0.84
TMC3-AS1-204ENST00000560851 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.26■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-204ENST00000560851 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.26■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-204ENST00000560851 CABP2Q9NPB3 220 aa20.24■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-204ENST00000560851 RGS12O14924 1447 aa20.24■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ATRNO75882 1429 aa20.24■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-204ENST00000560851 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.24■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-204ENST00000560851 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.23■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ACEP12821 1306 aa20.23■□□□□ 0.83
TMC3-AS1-204ENST00000560851 ALS2Q96Q42 1657 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms