RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-223ENST00000551137 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CS-223ENST00000551137 STK26Q9P289 416 aa16.82■□□□□ 0.28
CS-223ENST00000551137 SHPRHQ149N8 1683 aa16.81■□□□□ 0.28
CS-223ENST00000551137 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.81■□□□□ 0.28
CS-223ENST00000551137 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CS-223ENST00000551137 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.79■□□□□ 0.28
CS-223ENST00000551137 ORAI2Q96SN7 254 aa16.79■□□□□ 0.28
CS-223ENST00000551137 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.78■□□□□ 0.28
CS-223ENST00000551137 ADGRB1O14514 1584 aa16.78■□□□□ 0.28
CS-223ENST00000551137 DLC1Q96QB1 1528 aa16.78■□□□□ 0.28
CS-223ENST00000551137 LRP6O75581 1613 aa16.76■□□□□ 0.27
CS-223ENST00000551137 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-223ENST00000551137 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CS-223ENST00000551137 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-223ENST00000551137 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-223ENST00000551137 POTEAQ6S8J7 498 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-223ENST00000551137 ESCO1Q5FWF5 840 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-223ENST00000551137 PRAM1Q96QH2 718 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-223ENST00000551137 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-223ENST00000551137 PXDNQ92626 1479 aa16.69■□□□□ 0.26
CS-223ENST00000551137 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CS-223ENST00000551137 POGKQ9P215 609 aa16.69■□□□□ 0.26
CS-223ENST00000551137 ADGRB2O60241 1585 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-223ENST00000551137 FOXO3O43524 673 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-223ENST00000551137 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-223ENST00000551137 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-223ENST00000551137 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CS-223ENST00000551137 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-223ENST00000551137 KIF1AQ12756 1690 aa16.66■□□□□ 0.26
CS-223ENST00000551137 NUTM2FA1L443 756 aa16.66■□□□□ 0.26
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CS-223ENST00000551137 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CS-223ENST00000551137 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CS-223ENST00000551137 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CS-223ENST00000551137 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.64■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 PHF8Q9UPP1 1060 aa16.64■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 WASLO00401 505 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 AFF2P51816 1311 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa16.62■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 KRT28Q7Z3Y7 464 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 USP32Q8NFA0 1604 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 PSME1Q06323 249 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.59■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CS-223ENST00000551137 SBNO1A3KN83 1393 aa16.59■□□□□ 0.25
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CS-223ENST00000551137 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CS-223ENST00000551137 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-223ENST00000551137 ARHGEF10O15013 1369 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-223ENST00000551137 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
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CS-223ENST00000551137 NEUROD1Q13562 356 aa16.52■□□□□ 0.24
CS-223ENST00000551137 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CS-223ENST00000551137 CDK19Q9BWU1 502 aa16.52■□□□□ 0.24
CS-223ENST00000551137 USP21Q9UK80 565 aa16.52■□□□□ 0.24
CS-223ENST00000551137 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CS-223ENST00000551137 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.51■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 ITSN1Q15811 1721 aa16.5■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 ATRNO75882 1429 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 SLIT2O94813 1529 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 ALS2Q96Q42 1657 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-223ENST00000551137 UNC5CLQ8IV45 518 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 RGS12O14924 1447 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 ABCA3Q99758 1704 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 ACEP12821 1306 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CS-223ENST00000551137 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
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