RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547485.1

PTPRQ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 604 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-202ENST00000547485 WFS1O76024 890 aa10.16□□□□□ -0.78
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PTPRQ-202ENST00000547485 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
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PTPRQ-202ENST00000547485 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRQ-202ENST00000547485 ERBB4Q15303 1308 aa9.77□□□□□ -0.85
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