RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531388.1

CARNS1-206, Transcript of carnosine synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CARNS1, Length 5,065 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARNS1-206ENST00000531388 WWC1Q8IX03 1113 aa25.26■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 NUCB2P80303 420 aa25.24■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 TEFQ10587 303 aa25.24■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.23■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.23■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.23■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.22■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.22■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.22■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.21■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.21■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 GCC1Q96CN9 775 aa25.21■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.2■■□□□ 1.63
CARNS1-206ENST00000531388 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.2■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 GORABQ5T7V8 394 aa25.2■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.19■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.19■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.18■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.18■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 NECTIN2Q92692 538 aa25.17■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 CDK19Q9BWU1 502 aa25.16■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.16■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.16■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 CABP1Q9NZU7 370 aa25.15■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 KIF3AQ9Y496 699 aa25.15■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 MRE11P49959 708 aa25.15■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CARNS1-206ENST00000531388 TRAK2O60296 914 aa25.14■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.14■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.14■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 NPHP1O15259 732 aa25.13■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.12■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 MCTP1Q6DN14 999 aa25.1■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 ZNF428Q96B54 188 aa25.1■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.1■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.1■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.09■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 TPM4P67936 248 aa25.09■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.09■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 FCHSD2O94868 740 aa25.08■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 WDR62O43379 1518 aa25.08■■□□□ 1.61
CARNS1-206ENST00000531388 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.08■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 GNAI3P08754 354 aa25.07■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 RABEP1Q15276 862 aa25.07■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.06■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 SKAP1Q86WV1 359 aa25.06■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.06■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.05■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 H3BQV1 296 aa25.05■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 IFFO2Q5TF58 517 aa25.05■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 ATP10BO94823 1461 aa25.04■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.04■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 RAPGEF3O95398 923 aa25.04■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.04■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.03■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.03■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.03■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.03■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.03■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 ERC2O15083 957 aa25.02■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 ADGRL1O94910 1474 aa25.02■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 NLRP6P59044 892 aa25.02■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 ARID3AQ99856 593 aa25.02■■□□□ 1.6
CARNS1-206ENST00000531388 NUP160Q12769 1436 aa25.01■■□□□ 1.59
CARNS1-206ENST00000531388 PSME1Q06323 249 aa25.01■■□□□ 1.59
CARNS1-206ENST00000531388 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
CARNS1-206ENST00000531388 KIAA0556O60303 1618 aa25.01■■□□□ 1.59
CARNS1-206ENST00000531388 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.01■■□□□ 1.59
CARNS1-206ENST00000531388 ADAMTS12P58397 1594 aa25■■□□□ 1.59
CARNS1-206ENST00000531388 RNF20Q5VTR2 975 aa25■■□□□ 1.59
CARNS1-206ENST00000531388 TMEM57Q8N5G2 664 aa25■■□□□ 1.59
CARNS1-206ENST00000531388 IL27Q8NEV9 243 aa25■■□□□ 1.59
CARNS1-206ENST00000531388 SMC3Q9UQE7 1217 aa25■■□□□ 1.59
CARNS1-206ENST00000531388 ABCC11Q96J66 1382 aa25■■□□□ 1.59
CARNS1-206ENST00000531388 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms