RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519751.5

MSC-AS1-206, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 596 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-206ENST00000519751 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
MSC-AS1-206ENST00000519751 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
MSC-AS1-206ENST00000519751 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.1■■□□□ 1.29
MSC-AS1-206ENST00000519751 POGKQ9P215 609 aa23.08■■□□□ 1.29
MSC-AS1-206ENST00000519751 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.06■■□□□ 1.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.06■■□□□ 1.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 PRAM1Q96QH2 718 aa23.06■■□□□ 1.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 DLC1Q96QB1 1528 aa23.05■■□□□ 1.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 ORAI2Q96SN7 254 aa23.05■■□□□ 1.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 ADGRB1O14514 1584 aa23.03■■□□□ 1.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.03■■□□□ 1.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.03■■□□□ 1.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.03■■□□□ 1.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
MSC-AS1-206ENST00000519751 SOCS7O14512 581 aa23■■□□□ 1.27
MSC-AS1-206ENST00000519751 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
MSC-AS1-206ENST00000519751 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
MSC-AS1-206ENST00000519751 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
MSC-AS1-206ENST00000519751 NUTM2FA1L443 756 aa22.99■■□□□ 1.27
MSC-AS1-206ENST00000519751 SHPRHQ149N8 1683 aa22.99■■□□□ 1.27
MSC-AS1-206ENST00000519751 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
MSC-AS1-206ENST00000519751 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 FOXO3O43524 673 aa22.95■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 NEUROD1Q13562 356 aa22.95■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.94■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.94■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.94■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.93■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.91■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 LRP6O75581 1613 aa22.91■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.91■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.91■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 ADGRB2O60241 1585 aa22.9■■□□□ 1.26
MSC-AS1-206ENST00000519751 PSME1Q06323 249 aa22.89■■□□□ 1.25
MSC-AS1-206ENST00000519751 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
MSC-AS1-206ENST00000519751 KIF1AQ12756 1690 aa22.88■■□□□ 1.25
MSC-AS1-206ENST00000519751 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
MSC-AS1-206ENST00000519751 PXDNQ92626 1479 aa22.86■■□□□ 1.25
MSC-AS1-206ENST00000519751 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
MSC-AS1-206ENST00000519751 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.86■■□□□ 1.25
MSC-AS1-206ENST00000519751 POTEAQ6S8J7 498 aa22.85■■□□□ 1.25
MSC-AS1-206ENST00000519751 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.85■■□□□ 1.25
MSC-AS1-206ENST00000519751 C8orf37Q96NL8 207 aa22.82■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.82■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.82■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 TONSLQ96HA7 1378 aa22.81■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 ADAMTS2O95450 1211 aa22.81■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.8■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.8■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 NGLY1Q96IV0 654 aa22.8■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 AFF2P51816 1311 aa22.8■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 SBNO1A3KN83 1393 aa22.79■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 CDK19Q9BWU1 502 aa22.77■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.77■■□□□ 1.24
MSC-AS1-206ENST00000519751 ARHGEF10O15013 1369 aa22.76■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.76■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 RXRBP28702 533 aa22.75■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 USP32Q8NFA0 1604 aa22.75■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.74■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.74■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 USP21Q9UK80 565 aa22.71■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 ATP7BP35670 1465 aa22.71■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.71■■□□□ 1.23
MSC-AS1-206ENST00000519751 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
MSC-AS1-206ENST00000519751 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
MSC-AS1-206ENST00000519751 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.68■■□□□ 1.22
MSC-AS1-206ENST00000519751 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
MSC-AS1-206ENST00000519751 ITSN1Q15811 1721 aa22.68■■□□□ 1.22
MSC-AS1-206ENST00000519751 EVC2Q86UK5 1308 aa22.67■■□□□ 1.22
MSC-AS1-206ENST00000519751 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.66■■□□□ 1.22
MSC-AS1-206ENST00000519751 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
MSC-AS1-206ENST00000519751 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.66■■□□□ 1.22
MSC-AS1-206ENST00000519751 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
MSC-AS1-206ENST00000519751 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.65■■□□□ 1.22
MSC-AS1-206ENST00000519751 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
MSC-AS1-206ENST00000519751 ACEP12821 1306 aa22.63■■□□□ 1.21
MSC-AS1-206ENST00000519751 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.63■■□□□ 1.21
MSC-AS1-206ENST00000519751 CABP2Q9NPB3 220 aa22.63■■□□□ 1.21
MSC-AS1-206ENST00000519751 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.62■■□□□ 1.21
MSC-AS1-206ENST00000519751 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.62■■□□□ 1.21
MSC-AS1-206ENST00000519751 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.61■■□□□ 1.21
MSC-AS1-206ENST00000519751 PLEKHG5O94827 1062 aa22.61■■□□□ 1.21
MSC-AS1-206ENST00000519751 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.6■■□□□ 1.21
MSC-AS1-206ENST00000519751 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.59■■□□□ 1.21
MSC-AS1-206ENST00000519751 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
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