RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514834.1

ITGA3-214, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-214ENST00000514834 JCADQ9P266 1359 aa20.33■□□□□ 0.84
ITGA3-214ENST00000514834 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.31■□□□□ 0.84
ITGA3-214ENST00000514834 LAMC1P11047 1609 aa20.3■□□□□ 0.84
ITGA3-214ENST00000514834 ADGRB1O14514 1584 aa20.28■□□□□ 0.84
ITGA3-214ENST00000514834 LRP6O75581 1613 aa20.27■□□□□ 0.84
ITGA3-214ENST00000514834 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.27■□□□□ 0.84
ITGA3-214ENST00000514834 NUTM2FA1L443 756 aa20.27■□□□□ 0.84
ITGA3-214ENST00000514834 SHPRHQ149N8 1683 aa20.26■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 SIRT1Q96EB6 747 aa20.25■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 PRAM1Q96QH2 718 aa20.24■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.22■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 POTEAQ6S8J7 498 aa20.22■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.22■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.22■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.21■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.21■□□□□ 0.83
ITGA3-214ENST00000514834 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ITGA3-214ENST00000514834 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ITGA3-214ENST00000514834 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ITGA3-214ENST00000514834 DLC1Q96QB1 1528 aa20.19■□□□□ 0.82
ITGA3-214ENST00000514834 STAC3Q96MF2 364 aa20.19■□□□□ 0.82
ITGA3-214ENST00000514834 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.19■□□□□ 0.82
ITGA3-214ENST00000514834 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ITGA3-214ENST00000514834 FOXO3O43524 673 aa20.17■□□□□ 0.82
ITGA3-214ENST00000514834 POGKQ9P215 609 aa20.17■□□□□ 0.82
ITGA3-214ENST00000514834 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ITGA3-214ENST00000514834 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.15■□□□□ 0.82
ITGA3-214ENST00000514834 PXDNQ92626 1479 aa20.14■□□□□ 0.81
ITGA3-214ENST00000514834 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ITGA3-214ENST00000514834 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ITGA3-214ENST00000514834 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.14■□□□□ 0.81
ITGA3-214ENST00000514834 NEUROD1Q13562 356 aa20.13■□□□□ 0.81
ITGA3-214ENST00000514834 USP32Q8NFA0 1604 aa20.13■□□□□ 0.81
ITGA3-214ENST00000514834 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ITGA3-214ENST00000514834 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.11■□□□□ 0.81
ITGA3-214ENST00000514834 ADGRB2O60241 1585 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-214ENST00000514834 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-214ENST00000514834 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGA3-214ENST00000514834 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGA3-214ENST00000514834 KIF1AQ12756 1690 aa20.07■□□□□ 0.8
ITGA3-214ENST00000514834 ADAMTS2O95450 1211 aa20.07■□□□□ 0.8
ITGA3-214ENST00000514834 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.06■□□□□ 0.8
ITGA3-214ENST00000514834 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.06■□□□□ 0.8
ITGA3-214ENST00000514834 C8orf37Q96NL8 207 aa20.06■□□□□ 0.8
ITGA3-214ENST00000514834 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-214ENST00000514834 AFF2P51816 1311 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-214ENST00000514834 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-214ENST00000514834 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGA3-214ENST00000514834 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ITGA3-214ENST00000514834 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGA3-214ENST00000514834 NBPF8Q3BBV2 869 aa20■□□□□ 0.79
ITGA3-214ENST00000514834 NGLY1Q96IV0 654 aa20■□□□□ 0.79
ITGA3-214ENST00000514834 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa19.99■□□□□ 0.79
ITGA3-214ENST00000514834 PSME1Q06323 249 aa19.99■□□□□ 0.79
ITGA3-214ENST00000514834 CDK19Q9BWU1 502 aa19.99■□□□□ 0.79
ITGA3-214ENST00000514834 PLEKHG5O94827 1062 aa19.98■□□□□ 0.79
ITGA3-214ENST00000514834 CABLES1Q8TDN4 633 aa19.97■□□□□ 0.79
ITGA3-214ENST00000514834 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
ITGA3-214ENST00000514834 ATP7BP35670 1465 aa19.97■□□□□ 0.79
ITGA3-214ENST00000514834 TNS3Q68CZ2 1445 aa19.96■□□□□ 0.79
ITGA3-214ENST00000514834 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
ITGA3-214ENST00000514834 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
ITGA3-214ENST00000514834 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 SBNO1A3KN83 1393 aa19.95■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 RXRBP28702 533 aa19.94■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.94■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 QRICH2Q9H0J4 1663 aa19.93■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 USP21Q9UK80 565 aa19.92■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.91■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa19.91■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 ALS2Q96Q42 1657 aa19.91■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 ITSN1Q15811 1721 aa19.9■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 CABP2Q9NPB3 220 aa19.9■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 BCL9LQ86UU0 1499 aa19.9■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 ABCA3Q99758 1704 aa19.9■□□□□ 0.78
ITGA3-214ENST00000514834 GPRASP1Q5JY77 1395 aa19.89■□□□□ 0.77
ITGA3-214ENST00000514834 CCDC61Q9Y6R9 512 aa19.88■□□□□ 0.77
ITGA3-214ENST00000514834 ARHGEF10O15013 1369 aa19.87■□□□□ 0.77
ITGA3-214ENST00000514834 TONSLQ96HA7 1378 aa19.87■□□□□ 0.77
ITGA3-214ENST00000514834 ACEP12821 1306 aa19.87■□□□□ 0.77
ITGA3-214ENST00000514834 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
ITGA3-214ENST00000514834 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
ITGA3-214ENST00000514834 ATRNO75882 1429 aa19.86■□□□□ 0.77
ITGA3-214ENST00000514834 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
ITGA3-214ENST00000514834 RGS12O14924 1447 aa19.85■□□□□ 0.77
ITGA3-214ENST00000514834 PLEKHG3A1L390 1219 aa19.85■□□□□ 0.77
ITGA3-214ENST00000514834 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
ITGA3-214ENST00000514834 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
ITGA3-214ENST00000514834 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms