RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491293.1

C1orf35-206, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf35, Length 854 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-206ENST00000491293 PHLPP1O60346 1717 aa35.56■■■■□ 3.28
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C1orf35-206ENST00000491293 PRAM1Q96QH2 718 aa35.53■■■■□ 3.28
C1orf35-206ENST00000491293 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.52■■■■□ 3.28
C1orf35-206ENST00000491293 MST1RQ04912 1400 aa35.52■■■■□ 3.28
C1orf35-206ENST00000491293 SIRT1Q96EB6 747 aa35.52■■■■□ 3.28
C1orf35-206ENST00000491293 BRINP3Q76B58 766 aa35.48■■■■□ 3.27
C1orf35-206ENST00000491293 JCADQ9P266 1359 aa35.48■■■■□ 3.27
C1orf35-206ENST00000491293 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.46■■■■□ 3.27
C1orf35-206ENST00000491293 POGKQ9P215 609 aa35.45■■■■□ 3.27
C1orf35-206ENST00000491293 DLC1Q96QB1 1528 aa35.43■■■■□ 3.26
C1orf35-206ENST00000491293 NUTM2FA1L443 756 aa35.43■■■■□ 3.26
C1orf35-206ENST00000491293 POTEAQ6S8J7 498 aa35.43■■■■□ 3.26
C1orf35-206ENST00000491293 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
C1orf35-206ENST00000491293 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.42■■■■□ 3.26
C1orf35-206ENST00000491293 TONSLQ96HA7 1378 aa35.42■■■■□ 3.26
C1orf35-206ENST00000491293 ORAI2Q96SN7 254 aa35.41■■■■□ 3.26
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C1orf35-206ENST00000491293 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.35■■■■□ 3.25
C1orf35-206ENST00000491293 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
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C1orf35-206ENST00000491293 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
C1orf35-206ENST00000491293 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.29■■■■□ 3.24
C1orf35-206ENST00000491293 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.28■■■■□ 3.24
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C1orf35-206ENST00000491293 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
C1orf35-206ENST00000491293 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.22■■■■□ 3.23
C1orf35-206ENST00000491293 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.22■■■■□ 3.23
C1orf35-206ENST00000491293 SHPRHQ149N8 1683 aa35.21■■■■□ 3.23
C1orf35-206ENST00000491293 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
C1orf35-206ENST00000491293 FOXO3O43524 673 aa35.18■■■■□ 3.22
C1orf35-206ENST00000491293 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.17■■■■□ 3.22
C1orf35-206ENST00000491293 ADGRB2O60241 1585 aa35.17■■■■□ 3.22
C1orf35-206ENST00000491293 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.17■■■■□ 3.22
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C1orf35-206ENST00000491293 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.13■■■■□ 3.21
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C1orf35-206ENST00000491293 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
C1orf35-206ENST00000491293 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.11■■■■□ 3.21
C1orf35-206ENST00000491293 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
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C1orf35-206ENST00000491293 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.06■■■■□ 3.2
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C1orf35-206ENST00000491293 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.03■■■■□ 3.2
C1orf35-206ENST00000491293 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.03■■■■□ 3.2
C1orf35-206ENST00000491293 CABP2Q9NPB3 220 aa35.02■■■■□ 3.2
C1orf35-206ENST00000491293 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.01■■■■□ 3.2
C1orf35-206ENST00000491293 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.01■■■■□ 3.19
C1orf35-206ENST00000491293 AFF2P51816 1311 aa35■■■■□ 3.19
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C1orf35-206ENST00000491293 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.92■■■■□ 3.18
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C1orf35-206ENST00000491293 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.82■■■■□ 3.17
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C1orf35-206ENST00000491293 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.81■■■■□ 3.16
C1orf35-206ENST00000491293 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.8■■■■□ 3.16
C1orf35-206ENST00000491293 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
C1orf35-206ENST00000491293 USP47Q96K76 1375 aa34.79■■■■□ 3.16
C1orf35-206ENST00000491293 CABLES1Q8TDN4 633 aa34.78■■■■□ 3.16
C1orf35-206ENST00000491293 ITSN1Q15811 1721 aa34.78■■■■□ 3.16
C1orf35-206ENST00000491293 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP34.77■■■■□ 3.16
C1orf35-206ENST00000491293 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
C1orf35-206ENST00000491293 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
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