RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491264.5

HOXB-AS3-213, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 478 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-213ENST00000491264 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-213ENST00000491264 JCADQ9P266 1359 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ADGRB1O14514 1584 aa28.51■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DLC1Q96QB1 1528 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-213ENST00000491264 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-213ENST00000491264 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ORAI2Q96SN7 254 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NUTM2FA1L443 756 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.38■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TONSLQ96HA7 1378 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SHPRHQ149N8 1683 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FOXO3O43524 673 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ILDR2Q71H61 639 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ADGRB2O60241 1585 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-213ENST00000491264 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-213ENST00000491264 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KIF1AQ12756 1690 aa28.26■■■□□ 2.12
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LRP6O75581 1613 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PXDNQ92626 1479 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PSME1Q06323 249 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CDK19Q9BWU1 502 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP32Q8NFA0 1604 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ADAMTS2O95450 1211 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.14■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 C8orf37Q96NL8 207 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ATP7BP35670 1465 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 POTEAQ6S8J7 498 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SBNO1A3KN83 1393 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SOCS7O14512 581 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NGLY1Q96IV0 654 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 AFF2P51816 1311 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ITSN1Q15811 1721 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EVC2Q86UK5 1308 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ARHGEF10O15013 1369 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CABP2Q9NPB3 220 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PLEKHG5O94827 1062 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ACEP12821 1306 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-213ENST00000491264 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RXRBP28702 533 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP21Q9UK80 565 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-213ENST00000491264 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms