RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488989.1

CLDN11-208, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 4

Gene CLDN11, Length 600 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-208ENST00000488989 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CLDN11-208ENST00000488989 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.37■■□□□ 1.17
CLDN11-208ENST00000488989 ADGRB2O60241 1585 aa22.37■■□□□ 1.17
CLDN11-208ENST00000488989 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.36■■□□□ 1.17
CLDN11-208ENST00000488989 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.36■■□□□ 1.17
CLDN11-208ENST00000488989 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CLDN11-208ENST00000488989 CDCA8Q53HL2 280 aa22.32■■□□□ 1.16
CLDN11-208ENST00000488989 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CLDN11-208ENST00000488989 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
CLDN11-208ENST00000488989 EVC2Q86UK5 1308 aa22.31■■□□□ 1.16
CLDN11-208ENST00000488989 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CLDN11-208ENST00000488989 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.28■■□□□ 1.16
CLDN11-208ENST00000488989 MYOM1P52179 1685 aa22.27■■□□□ 1.16
CLDN11-208ENST00000488989 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.27■■□□□ 1.16
CLDN11-208ENST00000488989 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CLDN11-208ENST00000488989 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.25■■□□□ 1.15
CLDN11-208ENST00000488989 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.24■■□□□ 1.15
CLDN11-208ENST00000488989 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CLDN11-208ENST00000488989 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CLDN11-208ENST00000488989 CDK19Q9BWU1 502 aa22.22■■□□□ 1.15
CLDN11-208ENST00000488989 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CLDN11-208ENST00000488989 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.22■■□□□ 1.15
CLDN11-208ENST00000488989 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.21■■□□□ 1.15
CLDN11-208ENST00000488989 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.2■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 CABP2Q9NPB3 220 aa22.19■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.18■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 USP32Q8NFA0 1604 aa22.18■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 TMEM94Q12767 1356 aa22.18■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.18■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.18■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 ATP7BP35670 1465 aa22.17■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 ITSN1Q15811 1721 aa22.17■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.16■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 DCCP43146 1447 aa22.15■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.15■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CLDN11-208ENST00000488989 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CLDN11-208ENST00000488989 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN11-208ENST00000488989 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN11-208ENST00000488989 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CLDN11-208ENST00000488989 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CLDN11-208ENST00000488989 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.11■■□□□ 1.13
CLDN11-208ENST00000488989 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.1■■□□□ 1.13
CLDN11-208ENST00000488989 C14orf37Q86TY3 774 aa22.09■■□□□ 1.13
CLDN11-208ENST00000488989 AKAP12Q02952 1782 aa22.09■■□□□ 1.13
CLDN11-208ENST00000488989 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.09■■□□□ 1.13
CLDN11-208ENST00000488989 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.08■■□□□ 1.13
CLDN11-208ENST00000488989 PANK3Q9H999 370 aa22.08■■□□□ 1.13
CLDN11-208ENST00000488989 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.08■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 TMC1Q8TDI8 760 aa22.07■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 MSH6P52701 1360 aa22.07■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.06■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 CABP1Q9NZU7 370 aa22.06■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.06■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 MST1RQ04912 1400 aa22.04■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.03■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.03■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 A0A1W2PP64 1363 aa22.02■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 NUTM2FA1L443 756 aa22.02■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.02■■□□□ 1.12
CLDN11-208ENST00000488989 ATF3P18847 181 aa22.01■■□□□ 1.11
CLDN11-208ENST00000488989 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.01■■□□□ 1.11
CLDN11-208ENST00000488989 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CLDN11-208ENST00000488989 KIF1AQ12756 1690 aa22■■□□□ 1.11
CLDN11-208ENST00000488989 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-208ENST00000488989 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-208ENST00000488989 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CLDN11-208ENST00000488989 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.98■■□□□ 1.11
CLDN11-208ENST00000488989 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.97■■□□□ 1.11
CLDN11-208ENST00000488989 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.96■■□□□ 1.11
CLDN11-208ENST00000488989 ACEP12821 1306 aa21.96■■□□□ 1.11
CLDN11-208ENST00000488989 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.95■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.95■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 USP6P35125 1406 aa21.94■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.94■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 SSH2Q76I76 1423 aa21.93■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.93■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.93■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.92■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 ORAI2Q96SN7 254 aa21.92■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 ANP32CO43423 234 aa21.91■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 NSD2O96028 1365 aa21.9■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.89■■□□□ 1.1
CLDN11-208ENST00000488989 SLAIN2Q9P270 581 aa21.89■■□□□ 1.09
CLDN11-208ENST00000488989 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.88■■□□□ 1.09
CLDN11-208ENST00000488989 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CLDN11-208ENST00000488989 USP54Q70EL1 1684 aa21.85■■□□□ 1.09
CLDN11-208ENST00000488989 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.85■■□□□ 1.09
CLDN11-208ENST00000488989 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.85■■□□□ 1.09
CLDN11-208ENST00000488989 RALBP1Q15311 655 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms