RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484571.5

VWA3B-215, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 3

Gene VWA3B, Length 717 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-215ENST00000484571 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
VWA3B-215ENST00000484571 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
VWA3B-215ENST00000484571 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.11■■■□□ 2.41
VWA3B-215ENST00000484571 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.08■■■□□ 2.41
VWA3B-215ENST00000484571 DLC1Q96QB1 1528 aa30.06■■■□□ 2.4
VWA3B-215ENST00000484571 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.06■■■□□ 2.4
VWA3B-215ENST00000484571 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.04■■■□□ 2.4
VWA3B-215ENST00000484571 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
VWA3B-215ENST00000484571 ORAI2Q96SN7 254 aa30.04■■■□□ 2.4
VWA3B-215ENST00000484571 LRP6O75581 1613 aa30.04■■■□□ 2.4
VWA3B-215ENST00000484571 ADGRB1O14514 1584 aa30.03■■■□□ 2.4
VWA3B-215ENST00000484571 NPHP3Q7Z494 1330 aa30■■■□□ 2.39
VWA3B-215ENST00000484571 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30■■■□□ 2.39
VWA3B-215ENST00000484571 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.99■■■□□ 2.39
VWA3B-215ENST00000484571 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
VWA3B-215ENST00000484571 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.99■■■□□ 2.39
VWA3B-215ENST00000484571 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
VWA3B-215ENST00000484571 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
VWA3B-215ENST00000484571 PRAM1Q96QH2 718 aa29.96■■■□□ 2.39
VWA3B-215ENST00000484571 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.96■■■□□ 2.39
VWA3B-215ENST00000484571 POTEAQ6S8J7 498 aa29.95■■■□□ 2.39
VWA3B-215ENST00000484571 POGKQ9P215 609 aa29.93■■■□□ 2.38
VWA3B-215ENST00000484571 ADGRB2O60241 1585 aa29.91■■■□□ 2.38
VWA3B-215ENST00000484571 KIF1AQ12756 1690 aa29.91■■■□□ 2.38
VWA3B-215ENST00000484571 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
VWA3B-215ENST00000484571 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
VWA3B-215ENST00000484571 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
VWA3B-215ENST00000484571 PXDNQ92626 1479 aa29.9■■■□□ 2.38
VWA3B-215ENST00000484571 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.88■■■□□ 2.37
VWA3B-215ENST00000484571 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
VWA3B-215ENST00000484571 FOXO3O43524 673 aa29.87■■■□□ 2.37
VWA3B-215ENST00000484571 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.87■■■□□ 2.37
VWA3B-215ENST00000484571 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
VWA3B-215ENST00000484571 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.86■■■□□ 2.37
VWA3B-215ENST00000484571 NUTM2FA1L443 756 aa29.85■■■□□ 2.37
VWA3B-215ENST00000484571 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
VWA3B-215ENST00000484571 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.82■■■□□ 2.36
VWA3B-215ENST00000484571 AFF2P51816 1311 aa29.79■■■□□ 2.36
VWA3B-215ENST00000484571 PSME1Q06323 249 aa29.77■■■□□ 2.36
VWA3B-215ENST00000484571 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.76■■■□□ 2.36
VWA3B-215ENST00000484571 C8orf37Q96NL8 207 aa29.76■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.76■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.75■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 SBNO1A3KN83 1393 aa29.74■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 RXRBP28702 533 aa29.73■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 USP32Q8NFA0 1604 aa29.72■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 NGLY1Q96IV0 654 aa29.72■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 ADAMTS2O95450 1211 aa29.71■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.71■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.7■■■□□ 2.35
VWA3B-215ENST00000484571 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
VWA3B-215ENST00000484571 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
VWA3B-215ENST00000484571 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
VWA3B-215ENST00000484571 ARHGEF10O15013 1369 aa29.67■■■□□ 2.34
VWA3B-215ENST00000484571 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
VWA3B-215ENST00000484571 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.65■■■□□ 2.34
VWA3B-215ENST00000484571 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
VWA3B-215ENST00000484571 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.65■■■□□ 2.34
VWA3B-215ENST00000484571 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.64■■■□□ 2.34
VWA3B-215ENST00000484571 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.64■■■□□ 2.33
VWA3B-215ENST00000484571 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.62■■■□□ 2.33
VWA3B-215ENST00000484571 USP21Q9UK80 565 aa29.62■■■□□ 2.33
VWA3B-215ENST00000484571 ATP7BP35670 1465 aa29.61■■■□□ 2.33
VWA3B-215ENST00000484571 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
VWA3B-215ENST00000484571 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
VWA3B-215ENST00000484571 NEUROD1Q13562 356 aa29.59■■■□□ 2.33
VWA3B-215ENST00000484571 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
VWA3B-215ENST00000484571 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
VWA3B-215ENST00000484571 ITSN1Q15811 1721 aa29.59■■■□□ 2.33
VWA3B-215ENST00000484571 CDK19Q9BWU1 502 aa29.58■■■□□ 2.33
VWA3B-215ENST00000484571 ATRNO75882 1429 aa29.56■■■□□ 2.32
VWA3B-215ENST00000484571 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
VWA3B-215ENST00000484571 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.55■■■□□ 2.32
VWA3B-215ENST00000484571 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
VWA3B-215ENST00000484571 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.54■■■□□ 2.32
VWA3B-215ENST00000484571 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.54■■■□□ 2.32
VWA3B-215ENST00000484571 SLIT2O94813 1529 aa29.52■■■□□ 2.32
VWA3B-215ENST00000484571 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
VWA3B-215ENST00000484571 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
VWA3B-215ENST00000484571 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.51■■■□□ 2.31
VWA3B-215ENST00000484571 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.51■■■□□ 2.31
VWA3B-215ENST00000484571 RGS12O14924 1447 aa29.51■■■□□ 2.31
VWA3B-215ENST00000484571 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
VWA3B-215ENST00000484571 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.5■■■□□ 2.31
VWA3B-215ENST00000484571 ALS2Q96Q42 1657 aa29.5■■■□□ 2.31
VWA3B-215ENST00000484571 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
VWA3B-215ENST00000484571 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.48■■■□□ 2.31
VWA3B-215ENST00000484571 ABCA3Q99758 1704 aa29.45■■■□□ 2.31
VWA3B-215ENST00000484571 TONSLQ96HA7 1378 aa29.45■■■□□ 2.31
VWA3B-215ENST00000484571 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.45■■■□□ 2.31
VWA3B-215ENST00000484571 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.44■■■□□ 2.3
VWA3B-215ENST00000484571 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
VWA3B-215ENST00000484571 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
VWA3B-215ENST00000484571 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms