RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483521.1

PKN3-202, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

TSL 5

Gene PKN3, Length 597 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-202ENST00000483521 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.41■■□□□ 1.82
PKN3-202ENST00000483521 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.41■■□□□ 1.82
PKN3-202ENST00000483521 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PKN3-202ENST00000483521 ADGRB1O14514 1584 aa26.4■■□□□ 1.82
PKN3-202ENST00000483521 JCADQ9P266 1359 aa26.39■■□□□ 1.82
PKN3-202ENST00000483521 DLC1Q96QB1 1528 aa26.39■■□□□ 1.81
PKN3-202ENST00000483521 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.37■■□□□ 1.81
PKN3-202ENST00000483521 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.35■■□□□ 1.81
PKN3-202ENST00000483521 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PKN3-202ENST00000483521 PRAM1Q96QH2 718 aa26.33■■□□□ 1.81
PKN3-202ENST00000483521 POGKQ9P215 609 aa26.33■■□□□ 1.81
PKN3-202ENST00000483521 TONSLQ96HA7 1378 aa26.33■■□□□ 1.8
PKN3-202ENST00000483521 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.31■■□□□ 1.8
PKN3-202ENST00000483521 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.3■■□□□ 1.8
PKN3-202ENST00000483521 NEUROD1Q13562 356 aa26.29■■□□□ 1.8
PKN3-202ENST00000483521 ORAI2Q96SN7 254 aa26.29■■□□□ 1.8
PKN3-202ENST00000483521 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.29■■□□□ 1.8
PKN3-202ENST00000483521 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.28■■□□□ 1.8
PKN3-202ENST00000483521 SHPRHQ149N8 1683 aa26.28■■□□□ 1.8
PKN3-202ENST00000483521 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
PKN3-202ENST00000483521 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.27■■□□□ 1.8
PKN3-202ENST00000483521 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
PKN3-202ENST00000483521 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.26■■□□□ 1.79
PKN3-202ENST00000483521 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.26■■□□□ 1.79
PKN3-202ENST00000483521 ADGRB2O60241 1585 aa26.24■■□□□ 1.79
PKN3-202ENST00000483521 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.23■■□□□ 1.79
PKN3-202ENST00000483521 NUTM2FA1L443 756 aa26.22■■□□□ 1.79
PKN3-202ENST00000483521 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PKN3-202ENST00000483521 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
PKN3-202ENST00000483521 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
PKN3-202ENST00000483521 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PKN3-202ENST00000483521 ILDR2Q71H61 639 aa26.19■■□□□ 1.78
PKN3-202ENST00000483521 KIF1AQ12756 1690 aa26.19■■□□□ 1.78
PKN3-202ENST00000483521 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.18■■□□□ 1.78
PKN3-202ENST00000483521 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
PKN3-202ENST00000483521 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.16■■□□□ 1.78
PKN3-202ENST00000483521 FOXO3O43524 673 aa26.15■■□□□ 1.78
PKN3-202ENST00000483521 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.15■■□□□ 1.78
PKN3-202ENST00000483521 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PKN3-202ENST00000483521 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
PKN3-202ENST00000483521 LRP6O75581 1613 aa26.14■■□□□ 1.77
PKN3-202ENST00000483521 PXDNQ92626 1479 aa26.13■■□□□ 1.77
PKN3-202ENST00000483521 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PKN3-202ENST00000483521 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.12■■□□□ 1.77
PKN3-202ENST00000483521 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.11■■□□□ 1.77
PKN3-202ENST00000483521 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PKN3-202ENST00000483521 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PKN3-202ENST00000483521 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PKN3-202ENST00000483521 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.1■■□□□ 1.77
PKN3-202ENST00000483521 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PKN3-202ENST00000483521 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PKN3-202ENST00000483521 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PKN3-202ENST00000483521 USP32Q8NFA0 1604 aa26.07■■□□□ 1.76
PKN3-202ENST00000483521 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PKN3-202ENST00000483521 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PKN3-202ENST00000483521 PSME1Q06323 249 aa26.05■■□□□ 1.76
PKN3-202ENST00000483521 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PKN3-202ENST00000483521 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.04■■□□□ 1.76
PKN3-202ENST00000483521 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PKN3-202ENST00000483521 SOCS7O14512 581 aa26.02■■□□□ 1.76
PKN3-202ENST00000483521 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.02■■□□□ 1.76
PKN3-202ENST00000483521 ITSN1Q15811 1721 aa26.01■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.01■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 ATP7BP35670 1465 aa26■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 CDK19Q9BWU1 502 aa26■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.99■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 SBNO1A3KN83 1393 aa25.99■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.99■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.98■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 POTEAQ6S8J7 498 aa25.97■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 ADAMTS2O95450 1211 aa25.96■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 C8orf37Q96NL8 207 aa25.96■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.96■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 ARHGEF10O15013 1369 aa25.95■■□□□ 1.75
PKN3-202ENST00000483521 AFF2P51816 1311 aa25.94■■□□□ 1.74
PKN3-202ENST00000483521 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PKN3-202ENST00000483521 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.94■■□□□ 1.74
PKN3-202ENST00000483521 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PKN3-202ENST00000483521 NGLY1Q96IV0 654 aa25.92■■□□□ 1.74
PKN3-202ENST00000483521 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.92■■□□□ 1.74
PKN3-202ENST00000483521 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.91■■□□□ 1.74
PKN3-202ENST00000483521 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.9■■□□□ 1.74
PKN3-202ENST00000483521 EVC2Q86UK5 1308 aa25.89■■□□□ 1.74
PKN3-202ENST00000483521 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PKN3-202ENST00000483521 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PKN3-202ENST00000483521 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PKN3-202ENST00000483521 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.87■■□□□ 1.73
PKN3-202ENST00000483521 CABP2Q9NPB3 220 aa25.86■■□□□ 1.73
PKN3-202ENST00000483521 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.85■■□□□ 1.73
PKN3-202ENST00000483521 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PKN3-202ENST00000483521 ACEP12821 1306 aa25.85■■□□□ 1.73
PKN3-202ENST00000483521 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.84■■□□□ 1.73
PKN3-202ENST00000483521 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PKN3-202ENST00000483521 ALS2Q96Q42 1657 aa25.83■■□□□ 1.73
PKN3-202ENST00000483521 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PKN3-202ENST00000483521 RXRBP28702 533 aa25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms