RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
NELFE-208ENST00000481121 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.06■■■□□ 2.4
NELFE-208ENST00000481121 SIRT1Q96EB6 747 aa30.04■■■□□ 2.4
NELFE-208ENST00000481121 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.03■■■□□ 2.4
NELFE-208ENST00000481121 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.03■■■□□ 2.4
NELFE-208ENST00000481121 BRINP3Q76B58 766 aa30.02■■■□□ 2.4
NELFE-208ENST00000481121 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.02■■■□□ 2.4
NELFE-208ENST00000481121 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
NELFE-208ENST00000481121 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.01■■■□□ 2.39
NELFE-208ENST00000481121 PRAM1Q96QH2 718 aa30■■■□□ 2.39
NELFE-208ENST00000481121 ADGRB2O60241 1585 aa30■■■□□ 2.39
NELFE-208ENST00000481121 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.99■■■□□ 2.39
NELFE-208ENST00000481121 POGKQ9P215 609 aa29.96■■■□□ 2.39
NELFE-208ENST00000481121 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
NELFE-208ENST00000481121 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.95■■■□□ 2.38
NELFE-208ENST00000481121 SHPRHQ149N8 1683 aa29.94■■■□□ 2.38
NELFE-208ENST00000481121 TONSLQ96HA7 1378 aa29.93■■■□□ 2.38
NELFE-208ENST00000481121 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.92■■■□□ 2.38
NELFE-208ENST00000481121 KIF1AQ12756 1690 aa29.91■■■□□ 2.38
NELFE-208ENST00000481121 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.89■■■□□ 2.38
NELFE-208ENST00000481121 JCADQ9P266 1359 aa29.89■■■□□ 2.37
NELFE-208ENST00000481121 ORAI2Q96SN7 254 aa29.88■■■□□ 2.37
NELFE-208ENST00000481121 NUTM2FA1L443 756 aa29.87■■■□□ 2.37
NELFE-208ENST00000481121 USP32Q8NFA0 1604 aa29.87■■■□□ 2.37
NELFE-208ENST00000481121 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.85■■■□□ 2.37
NELFE-208ENST00000481121 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.84■■■□□ 2.37
NELFE-208ENST00000481121 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
NELFE-208ENST00000481121 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
NELFE-208ENST00000481121 ITSN1Q15811 1721 aa29.82■■■□□ 2.36
NELFE-208ENST00000481121 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
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NELFE-208ENST00000481121 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.8■■■□□ 2.36
NELFE-208ENST00000481121 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.8■■■□□ 2.36
NELFE-208ENST00000481121 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
NELFE-208ENST00000481121 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.77■■■□□ 2.36
NELFE-208ENST00000481121 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.76■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.75■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 PXDNQ92626 1479 aa29.75■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.74■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.74■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 LRP6O75581 1613 aa29.72■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.71■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 FOXO3O43524 673 aa29.71■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.71■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.71■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
NELFE-208ENST00000481121 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.7■■■□□ 2.34
NELFE-208ENST00000481121 ATP7BP35670 1465 aa29.7■■■□□ 2.34
NELFE-208ENST00000481121 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.67■■■□□ 2.34
NELFE-208ENST00000481121 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
NELFE-208ENST00000481121 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
NELFE-208ENST00000481121 CDK19Q9BWU1 502 aa29.62■■■□□ 2.33
NELFE-208ENST00000481121 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.61■■■□□ 2.33
NELFE-208ENST00000481121 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.61■■■□□ 2.33
NELFE-208ENST00000481121 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
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NELFE-208ENST00000481121 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
NELFE-208ENST00000481121 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
NELFE-208ENST00000481121 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
NELFE-208ENST00000481121 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
NELFE-208ENST00000481121 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.58■■■□□ 2.33
NELFE-208ENST00000481121 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
NELFE-208ENST00000481121 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.57■■■□□ 2.32
NELFE-208ENST00000481121 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.56■■■□□ 2.32
NELFE-208ENST00000481121 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
NELFE-208ENST00000481121 PSME1Q06323 249 aa29.55■■■□□ 2.32
NELFE-208ENST00000481121 ABCA3Q99758 1704 aa29.54■■■□□ 2.32
NELFE-208ENST00000481121 ALS2Q96Q42 1657 aa29.54■■■□□ 2.32
NELFE-208ENST00000481121 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.54■■■□□ 2.32
NELFE-208ENST00000481121 ILDR2Q71H61 639 aa29.54■■■□□ 2.32
NELFE-208ENST00000481121 SBNO1A3KN83 1393 aa29.53■■■□□ 2.32
NELFE-208ENST00000481121 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.51■■■□□ 2.32
NELFE-208ENST00000481121 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
NELFE-208ENST00000481121 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.32
NELFE-208ENST00000481121 EVC2Q86UK5 1308 aa29.51■■■□□ 2.31
NELFE-208ENST00000481121 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.5■■■□□ 2.31
NELFE-208ENST00000481121 CABP2Q9NPB3 220 aa29.5■■■□□ 2.31
NELFE-208ENST00000481121 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.5■■■□□ 2.31
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF10O15013 1369 aa29.48■■■□□ 2.31
NELFE-208ENST00000481121 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
NELFE-208ENST00000481121 ADAMTS2O95450 1211 aa29.45■■■□□ 2.31
NELFE-208ENST00000481121 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.44■■■□□ 2.3
NELFE-208ENST00000481121 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.44■■■□□ 2.3
NELFE-208ENST00000481121 C8orf37Q96NL8 207 aa29.44■■■□□ 2.3
NELFE-208ENST00000481121 ACEP12821 1306 aa29.43■■■□□ 2.3
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.42■■■□□ 2.3
NELFE-208ENST00000481121 AKAP12Q02952 1782 aa29.42■■■□□ 2.3
NELFE-208ENST00000481121 AFF2P51816 1311 aa29.41■■■□□ 2.3
NELFE-208ENST00000481121 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
NELFE-208ENST00000481121 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
NELFE-208ENST00000481121 POTEAQ6S8J7 498 aa29.39■■■□□ 2.3
NELFE-208ENST00000481121 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.38■■■□□ 2.29
NELFE-208ENST00000481121 USP47Q96K76 1375 aa29.38■■■□□ 2.29
NELFE-208ENST00000481121 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
NELFE-208ENST00000481121 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
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