RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.54■■■□□ 2
TRAPPC10-208ENST00000469521 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.52■■■□□ 2
TRAPPC10-208ENST00000469521 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.52■■■□□ 2
TRAPPC10-208ENST00000469521 SIRT1Q96EB6 747 aa27.52■■■□□ 2
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC10-208ENST00000469521 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRP6O75581 1613 aa27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADGRB2O60241 1585 aa27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC10-208ENST00000469521 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIF1AQ12756 1690 aa27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC10-208ENST00000469521 ORAI2Q96SN7 254 aa27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC10-208ENST00000469521 SOCS7O14512 581 aa27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRAM1Q96QH2 718 aa27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC10-208ENST00000469521 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC10-208ENST00000469521 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC10-208ENST00000469521 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC10-208ENST00000469521 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC10-208ENST00000469521 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC10-208ENST00000469521 PXDNQ92626 1479 aa27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC10-208ENST00000469521 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC10-208ENST00000469521 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC10-208ENST00000469521 POGKQ9P215 609 aa27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP32Q8NFA0 1604 aa27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC10-208ENST00000469521 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10-208ENST00000469521 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC10-208ENST00000469521 NUTM2FA1L443 756 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC10-208ENST00000469521 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC10-208ENST00000469521 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC10-208ENST00000469521 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 FOXO3O43524 673 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 POTEAQ6S8J7 498 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 ITSN1Q15811 1721 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC10-208ENST00000469521 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC10-208ENST00000469521 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC10-208ENST00000469521 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC10-208ENST00000469521 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC10-208ENST00000469521 NEUROD1Q13562 356 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP7BP35670 1465 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC10-208ENST00000469521 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC10-208ENST00000469521 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC10-208ENST00000469521 AFF2P51816 1311 aa27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABCA3Q99758 1704 aa27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC10-208ENST00000469521 SBNO1A3KN83 1393 aa27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC10-208ENST00000469521 C8orf37Q96NL8 207 aa27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADAMTS2O95450 1211 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSME1Q06323 249 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC10-208ENST00000469521 ALS2Q96Q42 1657 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC10-208ENST00000469521 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARHGEF10O15013 1369 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC10-208ENST00000469521 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC10-208ENST00000469521 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC10-208ENST00000469521 NGLY1Q96IV0 654 aa27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10-208ENST00000469521 TONSLQ96HA7 1378 aa27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDK19Q9BWU1 502 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC10-208ENST00000469521 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC10-208ENST00000469521 RXRBP28702 533 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 RALGAPBQ86X10 1494 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP21Q9UK80 565 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATRNO75882 1429 aa26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLIT2O94813 1529 aa26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 RGS12O14924 1447 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.92■■□□□ 1.9
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