RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468532.5

CHKB-205, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 5

Gene CHKB, Length 1,052 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-205ENST00000468532 NHSL1Q5SYE7 1610 aa45.28■■■■■ 4.84
CHKB-205ENST00000468532 ADGRB1O14514 1584 aa45.25■■■■■ 4.83
CHKB-205ENST00000468532 SIRT1Q96EB6 747 aa45.23■■■■■ 4.83
CHKB-205ENST00000468532 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.19■■■■■ 4.82
CHKB-205ENST00000468532 ORAI2Q96SN7 254 aa45.18■■■■■ 4.82
CHKB-205ENST00000468532 DLC1Q96QB1 1528 aa45.17■■■■■ 4.82
CHKB-205ENST00000468532 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
CHKB-205ENST00000468532 SHPRHQ149N8 1683 aa45.16■■■■■ 4.82
CHKB-205ENST00000468532 PRAM1Q96QH2 718 aa45.13■■■■■ 4.82
CHKB-205ENST00000468532 FMN2Q9NZ56 1722 aa45.11■■■■■ 4.81
CHKB-205ENST00000468532 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP45.1■■■■■ 4.81
CHKB-205ENST00000468532 TRAK1Q9UPV9 953 aa45.09■■■■■ 4.81
CHKB-205ENST00000468532 NUTM2FA1L443 756 aa45.08■■■■■ 4.81
CHKB-205ENST00000468532 POGKQ9P215 609 aa45.08■■■■■ 4.81
CHKB-205ENST00000468532 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa45.07■■■■■ 4.81
CHKB-205ENST00000468532 ESCO1Q5FWF5 840 aa45.07■■■■■ 4.81
CHKB-205ENST00000468532 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP45.05■■■■■ 4.8
CHKB-205ENST00000468532 SIN3AQ96ST3 1273 aa45.05■■■■■ 4.8
CHKB-205ENST00000468532 LRP6O75581 1613 aa45.02■■■■■ 4.8
CHKB-205ENST00000468532 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa45.02■■■■■ 4.8
CHKB-205ENST00000468532 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP44.99■■■■■ 4.79
CHKB-205ENST00000468532 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
CHKB-205ENST00000468532 NEUROD1Q13562 356 aa44.97■■■■■ 4.79
CHKB-205ENST00000468532 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
CHKB-205ENST00000468532 ADGRB2O60241 1585 aa44.95■■■■■ 4.79
CHKB-205ENST00000468532 L3MBTL2Q969R5 705 aa44.94■■■■■ 4.78
CHKB-205ENST00000468532 PNPLA6Q8IY17 1366 aa44.94■■■■■ 4.78
CHKB-205ENST00000468532 NPHP3Q7Z494 1330 aa44.93■■■■■ 4.78
CHKB-205ENST00000468532 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP44.92■■■■■ 4.78
CHKB-205ENST00000468532 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
CHKB-205ENST00000468532 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
CHKB-205ENST00000468532 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
CHKB-205ENST00000468532 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
CHKB-205ENST00000468532 KIF1AQ12756 1690 aa44.9■■■■■ 4.78
CHKB-205ENST00000468532 FOXO3O43524 673 aa44.89■■■■■ 4.78
CHKB-205ENST00000468532 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP44.89■■■■■ 4.78
CHKB-205ENST00000468532 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP44.88■■■■■ 4.78
CHKB-205ENST00000468532 SOCS7O14512 581 aa44.87■■■■■ 4.77
CHKB-205ENST00000468532 PXDNQ92626 1479 aa44.86■■■■■ 4.77
CHKB-205ENST00000468532 NBPF1Q3BBV0 1214 aa44.85■■■■■ 4.77
CHKB-205ENST00000468532 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP44.83■■■■■ 4.77
CHKB-205ENST00000468532 USP32Q8NFA0 1604 aa44.82■■■■■ 4.77
CHKB-205ENST00000468532 ANKARQ7Z5J8 1434 aa44.81■■■■■ 4.76
CHKB-205ENST00000468532 PHF8Q9UPP1 1060 aa44.79■■■■■ 4.76
CHKB-205ENST00000468532 POTEAQ6S8J7 498 aa44.78■■■■■ 4.76
CHKB-205ENST00000468532 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
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CHKB-205ENST00000468532 TULP4Q9NRJ4 1543 aa44.74■■■■■ 4.75
CHKB-205ENST00000468532 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
CHKB-205ENST00000468532 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa44.72■■■■■ 4.75
CHKB-205ENST00000468532 KRT28Q7Z3Y7 464 aa44.68■■■■■ 4.74
CHKB-205ENST00000468532 PRR36Q9H6K5 1346 aa44.68■■■■■ 4.74
CHKB-205ENST00000468532 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa44.66■■■■■ 4.74
CHKB-205ENST00000468532 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
CHKB-205ENST00000468532 ADAMTS2O95450 1211 aa44.63■■■■■ 4.74
CHKB-205ENST00000468532 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa44.62■■■■■ 4.73
CHKB-205ENST00000468532 C8orf37Q96NL8 207 aa44.62■■■■■ 4.73
CHKB-205ENST00000468532 AFF2P51816 1311 aa44.61■■■■■ 4.73
CHKB-205ENST00000468532 TONSLQ96HA7 1378 aa44.6■■■■■ 4.73
CHKB-205ENST00000468532 PSME1Q06323 249 aa44.6■■■■■ 4.73
CHKB-205ENST00000468532 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP44.59■■■■■ 4.73
CHKB-205ENST00000468532 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
CHKB-205ENST00000468532 ATP7BP35670 1465 aa44.58■■■■■ 4.73
CHKB-205ENST00000468532 ITSN1Q15811 1721 aa44.58■■■■■ 4.73
CHKB-205ENST00000468532 TNS3Q68CZ2 1445 aa44.57■■■■■ 4.72
CHKB-205ENST00000468532 CDK19Q9BWU1 502 aa44.56■■■■■ 4.72
CHKB-205ENST00000468532 QRICH2Q9H0J4 1663 aa44.55■■■■■ 4.72
CHKB-205ENST00000468532 NBPF8Q3BBV2 869 aa44.54■■■■■ 4.72
CHKB-205ENST00000468532 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
CHKB-205ENST00000468532 SBNO1A3KN83 1393 aa44.53■■■■■ 4.72
CHKB-205ENST00000468532 NGLY1Q96IV0 654 aa44.52■■■■■ 4.72
CHKB-205ENST00000468532 GPRASP1Q5JY77 1395 aa44.48■■■■■ 4.71
CHKB-205ENST00000468532 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
CHKB-205ENST00000468532 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
CHKB-205ENST00000468532 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP44.47■■■■■ 4.71
CHKB-205ENST00000468532 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa44.46■■■■■ 4.71
CHKB-205ENST00000468532 LMOD2Q6P5Q4 547 aa44.45■■■■■ 4.71
CHKB-205ENST00000468532 ARHGEF10O15013 1369 aa44.43■■■■■ 4.7
CHKB-205ENST00000468532 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.41■■■■■ 4.7
CHKB-205ENST00000468532 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
CHKB-205ENST00000468532 CCDC61Q9Y6R9 512 aa44.39■■■■■ 4.7
CHKB-205ENST00000468532 PLEKHG5O94827 1062 aa44.38■■■■■ 4.7
CHKB-205ENST00000468532 RXRBP28702 533 aa44.38■■■■■ 4.7
CHKB-205ENST00000468532 RALGAPBQ86X10 1494 aa44.37■■■■■ 4.69
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CHKB-205ENST00000468532 ABCA3Q99758 1704 aa44.36■■■■■ 4.69
CHKB-205ENST00000468532 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
CHKB-205ENST00000468532 CABLES1Q8TDN4 633 aa44.35■■■■■ 4.69
CHKB-205ENST00000468532 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
CHKB-205ENST00000468532 USP21Q9UK80 565 aa44.35■■■■■ 4.69
CHKB-205ENST00000468532 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
CHKB-205ENST00000468532 CABP2Q9NPB3 220 aa44.34■■■■■ 4.69
CHKB-205ENST00000468532 CARD11Q9BXL7 1154 aa44.32■■■■■ 4.69
CHKB-205ENST00000468532 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP44.31■■■■■ 4.68
CHKB-205ENST00000468532 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
CHKB-205ENST00000468532 ACEP12821 1306 aa44.29■■■■■ 4.68
CHKB-205ENST00000468532 PLEKHG3A1L390 1219 aa44.29■■■■■ 4.68
CHKB-205ENST00000468532 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa44.28■■■■■ 4.68
CHKB-205ENST00000468532 EVC2Q86UK5 1308 aa44.27■■■■■ 4.68
CHKB-205ENST00000468532 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
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