RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	ATRN	O75882	1429 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TTLL3-223	ENST00000466245	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
TTLL3-223	ENST00000466245	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		14.96	□□□□□ -0.02
TTLL3-223	ENST00000466245	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TTLL3-223	ENST00000466245	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TTLL3-223	ENST00000466245	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TTLL3-223	ENST00000466245	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TTLL3-223	ENST00000466245	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TTLL3-223	ENST00000466245	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
TTLL3-223	ENST00000466245	ORAI2	Q96SN7	254 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TTLL3-223	ENST00000466245	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TTLL3-223	ENST00000466245	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
TTLL3-223	ENST00000466245	MYOM2	P54296	1465 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	PPL	O60437	1756 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	IFT172	Q9UG01	1749 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		14.85	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	PXDN	Q92626	1479 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF1A	Q12756	1690 aa		14.84	□□□□□ -0.03
TTLL3-223	ENST00000466245	LRP5	O75197	1615 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TTLL3-223	ENST00000466245	FOXO3	O43524	673 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TTLL3-223	ENST00000466245	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TTLL3-223	ENST00000466245	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TTLL3-223	ENST00000466245	USP32	Q8NFA0	1604 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TTLL3-223	ENST00000466245	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TTLL3-223	ENST00000466245	GLI3	P10071	1580 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TTLL3-223	ENST00000466245	SLIT2	O94813	1529 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
TTLL3-223	ENST00000466245	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TTLL3-223	ENST00000466245	BAG6	P46379	1132 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TTLL3-223	ENST00000466245	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A0G2JS52	829 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	MYT1	Q01538	1121 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	PSME1	Q06323	249 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		14.77	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	TECPR2	O15040	1411 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	NUTM2F	A1L443	756 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	STK26	Q9P289	416 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	VPS72	Q15906	364 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	STAC3	Q96MF2	364 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGEF10	O15013	1369 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	PIK3C2G	O75747	1445 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-223	ENST00000466245	ABCC11	Q96J66	1382 aa		14.71	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	ABCA3	Q99758	1704 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	SBNO1	A3KN83	1393 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	RGL3	Q3MIN7	710 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	PLEKHG5	O94827	1062 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	SIRT1	Q96EB6	747 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	ADGRB2	O60241	1585 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		14.65	□□□□□ -0.06
TTLL3-223	ENST00000466245	NRAP	Q86VF7	1730 aa		14.64	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		14.64	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		14.62	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	BTG4	Q9NY30	223 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	ADGRB1	O14514	1584 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	DISP2	A7MBM2	1401 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM83G	A6ND36	823 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	POGK	Q9P215	609 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TTLL3-223	ENST00000466245	DLC1	Q96QB1	1528 aa		14.6	□□□□□ -0.07

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