RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	25.5	■■□□□ 1.67
USP19-210	ENST00000465902	POGK	Q9P215	609 aa		25.5	■■□□□ 1.67
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		25.5	■■□□□ 1.67
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		25.49	■■□□□ 1.67
USP19-210	ENST00000465902	PRAM1	Q96QH2	718 aa		25.48	■■□□□ 1.67
USP19-210	ENST00000465902	SIRT1	Q96EB6	747 aa		25.47	■■□□□ 1.67
USP19-210	ENST00000465902	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		25.45	■■□□□ 1.66
USP19-210	ENST00000465902	BRINP3	Q76B58	766 aa		25.44	■■□□□ 1.66
USP19-210	ENST00000465902	MST1R	Q04912	1400 aa		25.44	■■□□□ 1.66
USP19-210	ENST00000465902	JCAD	Q9P266	1359 aa		25.44	■■□□□ 1.66
USP19-210	ENST00000465902	DLC1	Q96QB1	1528 aa		25.43	■■□□□ 1.66
USP19-210	ENST00000465902	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	25.42	■■□□□ 1.66
USP19-210	ENST00000465902	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	25.42	■■□□□ 1.66
USP19-210	ENST00000465902	PHLPP1	O60346	1717 aa		25.41	■■□□□ 1.66
USP19-210	ENST00000465902	NUTM2F	A1L443	756 aa		25.41	■■□□□ 1.66
USP19-210	ENST00000465902	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		25.4	■■□□□ 1.66
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	25.39	■■□□□ 1.65
USP19-210	ENST00000465902	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	25.38	■■□□□ 1.65
USP19-210	ENST00000465902	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		25.38	■■□□□ 1.65
USP19-210	ENST00000465902	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		25.38	■■□□□ 1.65
USP19-210	ENST00000465902	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	25.37	■■□□□ 1.65
USP19-210	ENST00000465902	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	25.37	■■□□□ 1.65
USP19-210	ENST00000465902	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		25.36	■■□□□ 1.65
USP19-210	ENST00000465902	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	25.36	■■□□□ 1.65
USP19-210	ENST00000465902	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	25.35	■■□□□ 1.65
USP19-210	ENST00000465902	ORAI2	Q96SN7	254 aa		25.35	■■□□□ 1.65
USP19-210	ENST00000465902	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		25.35	■■□□□ 1.65
USP19-210	ENST00000465902	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		25.34	■■□□□ 1.65
USP19-210	ENST00000465902	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		25.34	■■□□□ 1.65
USP19-210	ENST00000465902	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		25.33	■■□□□ 1.64
USP19-210	ENST00000465902	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	25.31	■■□□□ 1.64
USP19-210	ENST00000465902	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	25.3	■■□□□ 1.64
USP19-210	ENST00000465902	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		25.28	■■□□□ 1.64
USP19-210	ENST00000465902	POTEA	Q6S8J7	498 aa		25.27	■■□□□ 1.64
USP19-210	ENST00000465902	ADGRB2	O60241	1585 aa		25.27	■■□□□ 1.64
USP19-210	ENST00000465902	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	25.26	■■□□□ 1.63
USP19-210	ENST00000465902	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	25.26	■■□□□ 1.63
USP19-210	ENST00000465902	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	25.25	■■□□□ 1.63
USP19-210	ENST00000465902	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		25.25	■■□□□ 1.63
USP19-210	ENST00000465902	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		25.23	■■□□□ 1.63
USP19-210	ENST00000465902	LRP6	O75581	1613 aa		25.23	■■□□□ 1.63
USP19-210	ENST00000465902	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	25.22	■■□□□ 1.63
USP19-210	ENST00000465902	FOXO3	O43524	673 aa		25.22	■■□□□ 1.63
USP19-210	ENST00000465902	SHPRH	Q149N8	1683 aa		25.22	■■□□□ 1.63
USP19-210	ENST00000465902	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		25.21	■■□□□ 1.63
USP19-210	ENST00000465902	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		25.21	■■□□□ 1.63
USP19-210	ENST00000465902	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		25.2	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	CDK19	Q9BWU1	502 aa		25.2	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		25.2	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	25.19	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	25.19	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	KIF1A	Q12756	1690 aa		25.19	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	USP32	Q8NFA0	1604 aa		25.19	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		25.18	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		25.18	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		25.17	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	25.17	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		25.17	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	25.15	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	25.15	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	25.15	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	25.15	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		25.15	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		25.14	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	25.14	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	25.14	■■□□□ 1.62
USP19-210	ENST00000465902	ITSN1	Q15811	1721 aa		25.13	■■□□□ 1.61
USP19-210	ENST00000465902	PSME1	Q06323	249 aa		25.12	■■□□□ 1.61
USP19-210	ENST00000465902	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		25.12	■■□□□ 1.61
USP19-210	ENST00000465902	CABP2	Q9NPB3	220 aa		25.1	■■□□□ 1.61
USP19-210	ENST00000465902	EVC2	Q86UK5	1308 aa		25.1	■■□□□ 1.61
USP19-210	ENST00000465902	PXDN	Q92626	1479 aa		25.09	■■□□□ 1.61
USP19-210	ENST00000465902	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	25.09	■■□□□ 1.61
USP19-210	ENST00000465902	ATP7B	P35670	1465 aa		25.09	■■□□□ 1.61
USP19-210	ENST00000465902	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		25.07	■■□□□ 1.6
USP19-210	ENST00000465902	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		25.05	■■□□□ 1.6
USP19-210	ENST00000465902	AFF2	P51816	1311 aa		25.03	■■□□□ 1.6
USP19-210	ENST00000465902	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		25.03	■■□□□ 1.6
USP19-210	ENST00000465902	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		25.01	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHG5	O94827	1062 aa		25.01	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	C8orf37	Q96NL8	207 aa		25.01	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		25.01	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		25.01	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	25	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTS2	O95450	1211 aa		24.99	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	ACE	P12821	1306 aa		24.99	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	RXRB	P28702	533 aa		24.99	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	USP47	Q96K76	1375 aa		24.99	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		24.99	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		24.97	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	SBNO1	A3KN83	1393 aa		24.97	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		24.97	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	CABP1	Q9NZU7	370 aa		24.97	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	24.97	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	NGLY1	Q96IV0	654 aa		24.96	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	24.95	■■□□□ 1.59
USP19-210	ENST00000465902	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	24.95	■■□□□ 1.58
USP19-210	ENST00000465902	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	24.93	■■□□□ 1.58
USP19-210	ENST00000465902	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	24.93	■■□□□ 1.58
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF10	O15013	1369 aa		24.93	■■□□□ 1.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.2 ms