RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462323.5

MUC4-208, Transcript of mucin 4, cell surface associated, human

TSL 5

Gene MUC4, Length 16,197 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC4-208	ENST00000462323	CTR9	Q6PD62	1173 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MUC4-208	ENST00000462323	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
MUC4-208	ENST00000462323	RUNDC1	Q96C34	613 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MUC4-208	ENST00000462323	TTC36	A6NLP5	189 aa		7.03	□□□□□ -1.28
MUC4-208	ENST00000462323	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	KIF3B	O15066	747 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	TRAK2	O60296	914 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	NUCB2	P80303	420 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	RIPK4	P57078	832 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	WIZ	O95785	1651 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	REC8	O95072	547 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	ROCK1	Q13464	1354 aa		7	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	TEX35	Q5T0J7	233 aa		7	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	WDR63	Q8IWG1	891 aa		7	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		7	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		7	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	STK26	Q9P289	416 aa		7	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		7	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	PTPRG	P23470	1445 aa		7	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		7	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	MCM5	P33992	734 aa		7	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	PANK1	Q8TE04	598 aa		7	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	STK31	Q9BXU1	1019 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	NCOA2	Q15596	1464 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	GPS2	Q13227	327 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	ZBTB9	Q96C00	473 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	EVC2	Q86UK5	1308 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	CEP83	Q9Y592	693 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	GGT6	Q6P531	493 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	SMARCA4	P51532	1647 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	6.98	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	SATB1	Q01826	763 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF853	P0CG23	659 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	OGFR	Q9NZT2	677 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	CCDC172	P0C7W6	258 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	GPATCH3	Q96I76	525 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	TOMM22	Q9NS69	142 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	CDC45	O75419	566 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	SLFN5	Q08AF3	891 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	APBB1	O00213	710 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	TNNT1	P13805	278 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	KIF16B	Q96L93	1317 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	RABEP1	Q15276	862 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	FEZ1	Q99689	392 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323		H0YHG0	523 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	MPND	Q8N594	471 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	CFTR	P13569	1480 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	HS1BP3	Q53T59	392 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	NAIP	Q13075	1403 aa		6.96	□□□□□ -1.29
MUC4-208	ENST00000462323	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MUC4-208	ENST00000462323	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MUC4-208	ENST00000462323	MCM4	P33991	863 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MUC4-208	ENST00000462323	GNAI1	P63096	354 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MUC4-208	ENST00000462323	ERICH4	A6NGS2	130 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MUC4-208	ENST00000462323	TPM3	P06753	285 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MUC4-208	ENST00000462323	ZBTB22	O15209	634 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MUC4-208	ENST00000462323	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MUC4-208	ENST00000462323	MAP3K1	Q13233	1512 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MUC4-208	ENST00000462323	YY1AP1	Q9H869	796 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MUC4-208	ENST00000462323	SETSIP	P0DME0	302 aa		6.95	□□□□□ -1.3

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