RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 NHSL1Q5SYE7 1610 aa40.34■■■■■ 4.05
FAAP20-210ENST00000440825 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa40.33■■■■■ 4.05
FAAP20-210ENST00000440825 NUTM2FA1L443 756 aa40.33■■■■■ 4.05
FAAP20-210ENST00000440825 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.31■■■■■ 4.04
FAAP20-210ENST00000440825 STAC3Q96MF2 364 aa40.29■■■■■ 4.04
FAAP20-210ENST00000440825 ESCO1Q5FWF5 840 aa40.28■■■■■ 4.04
FAAP20-210ENST00000440825 PRAM1Q96QH2 718 aa40.28■■■■■ 4.04
FAAP20-210ENST00000440825 SHPRHQ149N8 1683 aa40.27■■■■■ 4.04
FAAP20-210ENST00000440825 SIRT1Q96EB6 747 aa40.26■■■■■ 4.04
FAAP20-210ENST00000440825 POGKQ9P215 609 aa40.26■■■■■ 4.04
FAAP20-210ENST00000440825 TRAK1Q9UPV9 953 aa40.26■■■■■ 4.04
FAAP20-210ENST00000440825 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.25■■■■■ 4.03
FAAP20-210ENST00000440825 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
FAAP20-210ENST00000440825 ADGRB1O14514 1584 aa40.23■■■■■ 4.03
FAAP20-210ENST00000440825 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
FAAP20-210ENST00000440825 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
FAAP20-210ENST00000440825 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
FAAP20-210ENST00000440825 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
FAAP20-210ENST00000440825 SOCS7O14512 581 aa40.21■■■■■ 4.03
FAAP20-210ENST00000440825 LRP6O75581 1613 aa40.2■■■■■ 4.03
FAAP20-210ENST00000440825 DLC1Q96QB1 1528 aa40.17■■■■■ 4.02
FAAP20-210ENST00000440825 FMN2Q9NZ56 1722 aa40.16■■■■■ 4.02
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
FAAP20-210ENST00000440825 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.15■■■■■ 4.02
FAAP20-210ENST00000440825 NEUROD1Q13562 356 aa40.13■■■■■ 4.01
FAAP20-210ENST00000440825 FOXO3O43524 673 aa40.11■■■■■ 4.01
FAAP20-210ENST00000440825 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
FAAP20-210ENST00000440825 PNPLA6Q8IY17 1366 aa40.1■■■■■ 4.01
FAAP20-210ENST00000440825 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
FAAP20-210ENST00000440825 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
FAAP20-210ENST00000440825 NPHP3Q7Z494 1330 aa40.1■■■■■ 4.01
FAAP20-210ENST00000440825 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
FAAP20-210ENST00000440825 POTEAQ6S8J7 498 aa40.07■■■■■ 4.01
FAAP20-210ENST00000440825 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.03■■■■■ 4
FAAP20-210ENST00000440825 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
FAAP20-210ENST00000440825 PXDNQ92626 1479 aa39.99■■■■□ 3.99
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
FAAP20-210ENST00000440825 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa39.99■■■■□ 3.99
FAAP20-210ENST00000440825 KIF1AQ12756 1690 aa39.99■■■■□ 3.99
FAAP20-210ENST00000440825 NBPF1Q3BBV0 1214 aa39.98■■■■□ 3.99
FAAP20-210ENST00000440825 PHF8Q9UPP1 1060 aa39.98■■■■□ 3.99
FAAP20-210ENST00000440825 ADGRB2O60241 1585 aa39.97■■■■□ 3.99
FAAP20-210ENST00000440825 ADAMTS2O95450 1211 aa39.96■■■■□ 3.99
FAAP20-210ENST00000440825 C8orf37Q96NL8 207 aa39.94■■■■□ 3.98
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
FAAP20-210ENST00000440825 WASLO00401 505 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
FAAP20-210ENST00000440825 KRT28Q7Z3Y7 464 aa39.9■■■■□ 3.98
FAAP20-210ENST00000440825 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa39.9■■■■□ 3.98
FAAP20-210ENST00000440825 USP32Q8NFA0 1604 aa39.9■■■■□ 3.98
FAAP20-210ENST00000440825 AFF2P51816 1311 aa39.9■■■■□ 3.98
FAAP20-210ENST00000440825 ANKARQ7Z5J8 1434 aa39.89■■■■□ 3.98
FAAP20-210ENST00000440825 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
FAAP20-210ENST00000440825 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
FAAP20-210ENST00000440825 PSME1Q06323 249 aa39.84■■■■□ 3.97
FAAP20-210ENST00000440825 TULP4Q9NRJ4 1543 aa39.84■■■■□ 3.97
FAAP20-210ENST00000440825 NGLY1Q96IV0 654 aa39.83■■■■□ 3.97
FAAP20-210ENST00000440825 PRR36Q9H6K5 1346 aa39.83■■■■□ 3.97
FAAP20-210ENST00000440825 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa39.81■■■■□ 3.96
FAAP20-210ENST00000440825 PLEKHG5O94827 1062 aa39.8■■■■□ 3.96
FAAP20-210ENST00000440825 LMOD2Q6P5Q4 547 aa39.79■■■■□ 3.96
FAAP20-210ENST00000440825 CDK19Q9BWU1 502 aa39.76■■■■□ 3.96
FAAP20-210ENST00000440825 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa39.76■■■■□ 3.95
FAAP20-210ENST00000440825 TNS3Q68CZ2 1445 aa39.74■■■■□ 3.95
FAAP20-210ENST00000440825 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
FAAP20-210ENST00000440825 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
FAAP20-210ENST00000440825 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
FAAP20-210ENST00000440825 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
FAAP20-210ENST00000440825 TONSLQ96HA7 1378 aa39.72■■■■□ 3.95
FAAP20-210ENST00000440825 RXRBP28702 533 aa39.71■■■■□ 3.95
FAAP20-210ENST00000440825 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
FAAP20-210ENST00000440825 GPRASP1Q5JY77 1395 aa39.7■■■■□ 3.95
FAAP20-210ENST00000440825 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
FAAP20-210ENST00000440825 SBNO1A3KN83 1393 aa39.69■■■■□ 3.94
FAAP20-210ENST00000440825 ATP7BP35670 1465 aa39.68■■■■□ 3.94
FAAP20-210ENST00000440825 ITSN1Q15811 1721 aa39.68■■■■□ 3.94
FAAP20-210ENST00000440825 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.66■■■■□ 3.94
FAAP20-210ENST00000440825 USP21Q9UK80 565 aa39.66■■■■□ 3.94
FAAP20-210ENST00000440825 QRICH2Q9H0J4 1663 aa39.66■■■■□ 3.94
FAAP20-210ENST00000440825 CABLES1Q8TDN4 633 aa39.65■■■■□ 3.94
FAAP20-210ENST00000440825 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
FAAP20-210ENST00000440825 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGEF10O15013 1369 aa39.62■■■■□ 3.93
FAAP20-210ENST00000440825 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
FAAP20-210ENST00000440825 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
FAAP20-210ENST00000440825 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
FAAP20-210ENST00000440825 CABP2Q9NPB3 220 aa39.58■■■■□ 3.93
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC61Q9Y6R9 512 aa39.57■■■■□ 3.93
FAAP20-210ENST00000440825 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
FAAP20-210ENST00000440825 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa39.54■■■■□ 3.92
FAAP20-210ENST00000440825 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
FAAP20-210ENST00000440825 ACEP12821 1306 aa39.52■■■■□ 3.92
FAAP20-210ENST00000440825 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.52■■■■□ 3.92
FAAP20-210ENST00000440825 CARD11Q9BXL7 1154 aa39.5■■■■□ 3.91
FAAP20-210ENST00000440825 ABCA3Q99758 1704 aa39.5■■■■□ 3.91
FAAP20-210ENST00000440825 ALS2Q96Q42 1657 aa39.5■■■■□ 3.91
FAAP20-210ENST00000440825 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa39.48■■■■□ 3.91
FAAP20-210ENST00000440825 BCL9LQ86UU0 1499 aa39.47■■■■□ 3.91
FAAP20-210ENST00000440825 EVC2Q86UK5 1308 aa39.46■■■■□ 3.91
FAAP20-210ENST00000440825 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms