RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 APAF1O14727 1248 aa4.79□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA2Q08379 1002 aa4.79□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 NFKBIBQ15653 356 aa4.79□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa4.79□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa4.79□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 RARSP54136 660 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PIK3R4Q99570 1358 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHF1Q96S99 279 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 NINLQ9Y2I6 1382 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM161AQ3B820 660 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 FBLN2P98095 1184 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 FSD2A1L4K1 749 aa4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 CGNL1Q0VF96 1302 aa4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 ASXL2Q76L83 1435 aa4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 NBR1Q14596 966 aa4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF2CQ99661 725 aa4.77□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC4A3P48751 1232 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 GLI2P10070 1586 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D32Q96NH3 1257 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 SMC5Q8IY18 1101 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 NSD3Q9BZ95 1437 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 E9PSI1 815 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 CLUAP1Q96AJ1 413 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM35Q9UPQ4 493 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS12O14924 1447 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 TCP11L2Q8N4U5 519 aa4.75□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa4.75□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 POGKQ9P215 609 aa4.75□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 QRICH2Q9H0J4 1663 aa4.75□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 KNSTRNQ9Y448 316 aa4.75□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 NSD2O96028 1365 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 PANK1Q8TE04 598 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PP64 1363 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 GSE1Q14687 1217 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR3GLQ9BT43 218 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC7Q96NW7 1537 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC146Q8IYE0 955 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 DLC1Q96QB1 1528 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR63Q8IWG1 891 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 AAMPQ13685 434 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF853P0CG23 659 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D2Q9BYX2 928 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 CDCA8Q53HL2 280 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF1BO60333 1816 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 NEO1Q92859 1461 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP10DQ9P241 1426 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF3BO15066 747 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 COG6Q9Y2V7 657 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 NEFMP07197 916 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 SIRT2Q8IXJ6 389 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 TECPR2O15040 1411 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM135BQ49AJ0 1406 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 KNDC1Q76NI1 1749 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 RICTORQ6R327 1708 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 PTCH1Q13635 1447 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 FYB1O15117 783 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM27P14373 513 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 MTHFSP49914 203 aa4.71□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC17AQ6ZS10 378 aa4.71□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 REREQ9P2R6 1566 aa4.71□□□□□ -1.65
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM25P49756 843 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 IL16Q14005 1332 aa4.71□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 SSH1Q8WYL5 1049 aa4.71□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 RUNDC1Q96C34 613 aa4.71□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 SSH2Q76I76 1423 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 IDI1Q13907 227 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1B-203ENST00000419445 MVPQ14764 893 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
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