RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409483.5

PTPRN2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-205ENST00000409483 GORABQ5T7V8 394 aa20.38■□□□□ 0.85
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PTPRN2-205ENST00000409483 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRN2-205ENST00000409483 PDE3AQ14432 1141 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRN2-205ENST00000409483 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRN2-205ENST00000409483 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.37■□□□□ 0.85
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PTPRN2-205ENST00000409483 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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PTPRN2-205ENST00000409483 GPATCH3Q96I76 525 aa20.34■□□□□ 0.85
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PTPRN2-205ENST00000409483 IDI1Q13907 227 aa20.31■□□□□ 0.84
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PTPRN2-205ENST00000409483 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.24■□□□□ 0.83
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PTPRN2-205ENST00000409483 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN2-205ENST00000409483 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.23■□□□□ 0.83
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PTPRN2-205ENST00000409483 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRN2-205ENST00000409483 AAMPQ13685 434 aa20.2■□□□□ 0.82
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PTPRN2-205ENST00000409483 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRN2-205ENST00000409483 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRN2-205ENST00000409483 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRN2-205ENST00000409483 IGHDP01880 384 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRN2-205ENST00000409483 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRN2-205ENST00000409483 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRN2-205ENST00000409483 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRN2-205ENST00000409483 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRN2-205ENST00000409483 NEK4P51957 841 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRN2-205ENST00000409483 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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