RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399336.8

NOMO3-202, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 4,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-202ENST00000399336 AAMPQ13685 434 aa22.7■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.7■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.7■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 WDR63Q8IWG1 891 aa22.7■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.7■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.7■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 PTMSP20962 102 aa22.67■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.66■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.66■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.66■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.64■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.64■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
NOMO3-202ENST00000399336 TESK2Q96S53 571 aa22.64■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 TEFQ10587 303 aa22.64■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.63■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.61■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.61■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.6■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 REC8O95072 547 aa22.6■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.59■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 NLRP6P59044 892 aa22.59■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.59■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 WDR62O43379 1518 aa22.58■■□□□ 1.21
NOMO3-202ENST00000399336 IDI1Q13907 227 aa22.58■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.57■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.57■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 GPATCH3Q96I76 525 aa22.57■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.57■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.57■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 PZPP20742 1482 aa22.56■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 DRC7Q8IY82 874 aa22.55■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.55■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 ADGRL1O94910 1474 aa22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 CDC45O75419 566 aa22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 IGHDP01880 384 aa22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.52■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.52■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
NOMO3-202ENST00000399336 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.52■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 NOS1P29475 1434 aa22.51■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 FBLN1P23142 703 aa22.51■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 PSME1Q06323 249 aa22.51■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 TRAK2O60296 914 aa22.5■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 SLC4A2P04920 1241 aa22.5■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 FCHSD2O94868 740 aa22.5■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 DCTN1Q14203 1278 aa22.5■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 KIAA0556O60303 1618 aa22.5■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.49■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 GORABQ5T7V8 394 aa22.49■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.49■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 ADAMTS12P58397 1594 aa22.49■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 MCTP1Q6DN14 999 aa22.48■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.48■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.48■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 DISP1Q96F81 1524 aa22.48■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.48■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.48■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 CD109Q6YHK3 1445 aa22.48■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.48■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.48■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.47■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 GCC1Q96CN9 775 aa22.47■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 NPHP1O15259 732 aa22.46■■□□□ 1.19
NOMO3-202ENST00000399336 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.45■■□□□ 1.18
NOMO3-202ENST00000399336 FANCAO15360 1455 aa22.45■■□□□ 1.18
NOMO3-202ENST00000399336 NFE2L2Q16236 605 aa22.45■■□□□ 1.18
NOMO3-202ENST00000399336 ABTB2Q8N961 1025 aa22.45■■□□□ 1.18
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.45■■□□□ 1.18
NOMO3-202ENST00000399336 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.45■■□□□ 1.18
NOMO3-202ENST00000399336 TRIM27P14373 513 aa22.44■■□□□ 1.18
NOMO3-202ENST00000399336 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.44■■□□□ 1.18
NOMO3-202ENST00000399336 NME9Q86XW9 330 aa22.44■■□□□ 1.18
NOMO3-202ENST00000399336 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
NOMO3-202ENST00000399336 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms