RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.02■■■□□ 2.4
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UBE2E3-201ENST00000392415 ADGRB1O14514 1584 aa29.98■■■□□ 2.39
UBE2E3-201ENST00000392415 SHPRHQ149N8 1683 aa29.97■■■□□ 2.39
UBE2E3-201ENST00000392415 ORAI2Q96SN7 254 aa29.96■■■□□ 2.39
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.94■■■□□ 2.38
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
UBE2E3-201ENST00000392415 DLC1Q96QB1 1528 aa29.94■■■□□ 2.38
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
UBE2E3-201ENST00000392415 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
UBE2E3-201ENST00000392415 PRAM1Q96QH2 718 aa29.91■■■□□ 2.38
UBE2E3-201ENST00000392415 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.89■■■□□ 2.37
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
UBE2E3-201ENST00000392415 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.88■■■□□ 2.37
UBE2E3-201ENST00000392415 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
UBE2E3-201ENST00000392415 SOCS7O14512 581 aa29.86■■■□□ 2.37
UBE2E3-201ENST00000392415 POGKQ9P215 609 aa29.86■■■□□ 2.37
UBE2E3-201ENST00000392415 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.86■■■□□ 2.37
UBE2E3-201ENST00000392415 LRP6O75581 1613 aa29.85■■■□□ 2.37
UBE2E3-201ENST00000392415 NUTM2FA1L443 756 aa29.85■■■□□ 2.37
UBE2E3-201ENST00000392415 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.84■■■□□ 2.37
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.82■■■□□ 2.36
UBE2E3-201ENST00000392415 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.81■■■□□ 2.36
UBE2E3-201ENST00000392415 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.81■■■□□ 2.36
UBE2E3-201ENST00000392415 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.8■■■□□ 2.36
UBE2E3-201ENST00000392415 ADGRB2O60241 1585 aa29.79■■■□□ 2.36
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXO3O43524 673 aa29.77■■■□□ 2.36
UBE2E3-201ENST00000392415 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.77■■■□□ 2.36
UBE2E3-201ENST00000392415 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
UBE2E3-201ENST00000392415 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
UBE2E3-201ENST00000392415 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
UBE2E3-201ENST00000392415 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
UBE2E3-201ENST00000392415 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
UBE2E3-201ENST00000392415 PXDNQ92626 1479 aa29.75■■■□□ 2.35
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF1AQ12756 1690 aa29.75■■■□□ 2.35
UBE2E3-201ENST00000392415 POTEAQ6S8J7 498 aa29.74■■■□□ 2.35
UBE2E3-201ENST00000392415 NEUROD1Q13562 356 aa29.72■■■□□ 2.35
UBE2E3-201ENST00000392415 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.71■■■□□ 2.35
UBE2E3-201ENST00000392415 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
UBE2E3-201ENST00000392415 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.7■■■□□ 2.35
UBE2E3-201ENST00000392415 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.7■■■□□ 2.34
UBE2E3-201ENST00000392415 USP32Q8NFA0 1604 aa29.69■■■□□ 2.34
UBE2E3-201ENST00000392415 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
UBE2E3-201ENST00000392415 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
UBE2E3-201ENST00000392415 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
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UBE2E3-201ENST00000392415 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.64■■■□□ 2.34
UBE2E3-201ENST00000392415 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.63■■■□□ 2.33
UBE2E3-201ENST00000392415 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.62■■■□□ 2.33
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.61■■■□□ 2.33
UBE2E3-201ENST00000392415 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.6■■■□□ 2.33
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UBE2E3-201ENST00000392415 C8orf37Q96NL8 207 aa29.58■■■□□ 2.33
UBE2E3-201ENST00000392415 SBNO1A3KN83 1393 aa29.54■■■□□ 2.32
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK19Q9BWU1 502 aa29.54■■■□□ 2.32
UBE2E3-201ENST00000392415 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.54■■■□□ 2.32
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP7BP35670 1465 aa29.54■■■□□ 2.32
UBE2E3-201ENST00000392415 NGLY1Q96IV0 654 aa29.53■■■□□ 2.32
UBE2E3-201ENST00000392415 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
UBE2E3-201ENST00000392415 ITSN1Q15811 1721 aa29.52■■■□□ 2.32
UBE2E3-201ENST00000392415 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
UBE2E3-201ENST00000392415 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.5■■■□□ 2.31
UBE2E3-201ENST00000392415 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
UBE2E3-201ENST00000392415 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
UBE2E3-201ENST00000392415 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.48■■■□□ 2.31
UBE2E3-201ENST00000392415 TONSLQ96HA7 1378 aa29.48■■■□□ 2.31
UBE2E3-201ENST00000392415 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
UBE2E3-201ENST00000392415 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
UBE2E3-201ENST00000392415 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.47■■■□□ 2.31
UBE2E3-201ENST00000392415 RXRBP28702 533 aa29.46■■■□□ 2.31
UBE2E3-201ENST00000392415 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF10O15013 1369 aa29.46■■■□□ 2.31
UBE2E3-201ENST00000392415 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.45■■■□□ 2.3
UBE2E3-201ENST00000392415 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.44■■■□□ 2.3
UBE2E3-201ENST00000392415 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.43■■■□□ 2.3
UBE2E3-201ENST00000392415 USP21Q9UK80 565 aa29.43■■■□□ 2.3
UBE2E3-201ENST00000392415 ALS2Q96Q42 1657 aa29.42■■■□□ 2.3
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
UBE2E3-201ENST00000392415 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.4■■■□□ 2.3
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
UBE2E3-201ENST00000392415 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.4■■■□□ 2.3
UBE2E3-201ENST00000392415 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
UBE2E3-201ENST00000392415 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCA3Q99758 1704 aa29.38■■■□□ 2.29
UBE2E3-201ENST00000392415 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
UBE2E3-201ENST00000392415 CABP2Q9NPB3 220 aa29.37■■■□□ 2.29
UBE2E3-201ENST00000392415 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
UBE2E3-201ENST00000392415 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.36■■■□□ 2.29
UBE2E3-201ENST00000392415 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.36■■■□□ 2.29
UBE2E3-201ENST00000392415 ACEP12821 1306 aa29.36■■■□□ 2.29
UBE2E3-201ENST00000392415 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
UBE2E3-201ENST00000392415 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.34■■■□□ 2.29
UBE2E3-201ENST00000392415 ATRNO75882 1429 aa29.33■■■□□ 2.29
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