RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390935.1

RNA5SP18-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 18, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP18, Length 121 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP18-201ENST00000390935 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
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RNA5SP18-201ENST00000390935 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.39□□□□□ -0.59
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RNA5SP18-201ENST00000390935 KNDC1Q76NI1 1749 aa11.38□□□□□ -0.59
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RNA5SP18-201ENST00000390935 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RNA5SP18-201ENST00000390935 NUTM2FA1L443 756 aa11.37□□□□□ -0.59
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RNA5SP18-201ENST00000390935 LAMC1P11047 1609 aa11.35□□□□□ -0.59
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RNA5SP18-201ENST00000390935 ADGRB1O14514 1584 aa11.32□□□□□ -0.6
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RNA5SP18-201ENST00000390935 DLC1Q96QB1 1528 aa11.3□□□□□ -0.6
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RNA5SP18-201ENST00000390935 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.27□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 RXRBP28702 533 aa11.26□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.26□□□□□ -0.61
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RNA5SP18-201ENST00000390935 USP32Q8NFA0 1604 aa11.26□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 KIF1AQ12756 1690 aa11.26□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.25□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.25□□□□□ -0.61
RNA5SP18-201ENST00000390935 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
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RNA5SP18-201ENST00000390935 NEUROD1Q13562 356 aa11.22□□□□□ -0.61
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RNA5SP18-201ENST00000390935 TULP4Q9NRJ4 1543 aa11.2□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RNA5SP18-201ENST00000390935 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.19□□□□□ -0.62
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RNA5SP18-201ENST00000390935 CDK19Q9BWU1 502 aa11.19□□□□□ -0.62
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RNA5SP18-201ENST00000390935 ITSN1Q15811 1721 aa11.16□□□□□ -0.62
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RNA5SP18-201ENST00000390935 SLIT2O94813 1529 aa11.14□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.14□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 FAM83GA6ND36 823 aa11.14□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.14□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 ACEP12821 1306 aa11.13□□□□□ -0.63
RNA5SP18-201ENST00000390935 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
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RNA5SP18-201ENST00000390935 CABP2Q9NPB3 220 aa11.13□□□□□ -0.63
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