RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365620.1

RNU6-597P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 597, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-597P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-597P-201ENST00000365620 HPS1Q92902 700 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 MRGPRX2Q96LB1 330 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 GPR37O15354 613 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 WIPF1O43516 503 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 WNT7AO00755 349 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 TERTO14746 1132 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 GNPATO15228 680 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 TRIM32Q13049 653 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 HLA-CQ95604 372 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 STK17AQ9UEE5 414 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 SKOR1P84550 965 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 TRIM47Q96LD4 638 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 MSS51Q4VC12 460 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 CCDC24Q8N4L8 307 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 BMP1P13497 986 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 VEGFBP49765 207 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 MMP16P51512 607 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-597P-201ENST00000365620 DXOO77932 396 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 ALDH1A1P00352 501 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 GMPRP36959 345 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 GUCA2AQ02747 115 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 SULF1Q8IWU6 871 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 SENP2Q9HC62 589 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 P3H3Q8IVL6 736 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 CD46P15529 392 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 Q3C1V9 767 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 TRIM46Q7Z4K8 759 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 GRIPAP1Q4V328 841 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 ERBB4Q15303 1308 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 KDM4AO75164 1064 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 KIFC2Q96AC6 838 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-597P-201ENST00000365620 SIAH2O43255 324 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 WNT7BP56706 349 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 SOBPA7XYQ1 873 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 HOXA2O43364 376 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 SMYD5Q6GMV2 418 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 EHBP1Q8NDI1 1231 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 SLC16A10Q8TF71 515 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 JUNDP17535 347 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 LINC01559Q495D7 138 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 ZFP42Q96MM3 310 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 NUDT12Q9BQG2 462 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 TLL2Q9Y6L7 1015 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 WASF2Q9Y6W5 498 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 H3BM21 787 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 SH3BP2P78314 561 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 PCDHGC3Q9UN70 934 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 IRF7Q92985 503 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 USP46P62068 366 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 BAP1Q92560 729 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-597P-201ENST00000365620 FAM181BA6NEQ2 426 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 IRF6O14896 467 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 MAP2K5Q13163 448 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 C6orf229H3BNL8 230 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 RETREG3Q86VR2 466 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 CCDC102AQ96A19 550 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 UNC93B1Q9H1C4 597 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 CCNYL3P0C7X3 344 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 FDX1P10109 184 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 MS4A1P11836 297 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 NDUFV2P19404 249 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 NNTQ13423 1086 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 TIMP2P16035 220 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 WDR4P57081 412 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 NUTM1Q86Y26 1132 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 C6orf118Q5T5N4 469 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 ZNF511Q8NB15 262 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 ZFAND3Q9H8U3 227 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 GPCPD1Q9NPB8 672 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 MOXD2PA6NHM9 499 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 GSK3AP49840 483 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 KCNH2Q12809 1159 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 SCARF1Q14162 830 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 ARID5BQ14865 1188 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 PRR7Q8TB68 274 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-597P-201ENST00000365620 EVA1BQ9NVM1 165 aa4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms