RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316436.3

LSMEM2-201, Transcript of leucine rich single-pass membrane protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LSMEM2, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSMEM2-201ENST00000316436 SIRT1Q96EB6 747 aa22.27■■□□□ 1.16
LSMEM2-201ENST00000316436 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.27■■□□□ 1.16
LSMEM2-201ENST00000316436 MYOM1P52179 1685 aa22.27■■□□□ 1.15
LSMEM2-201ENST00000316436 CCDC7Q96M83 1385 aa22.26■■□□□ 1.15
LSMEM2-201ENST00000316436 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.25■■□□□ 1.15
LSMEM2-201ENST00000316436 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
LSMEM2-201ENST00000316436 POGKQ9P215 609 aa22.23■■□□□ 1.15
LSMEM2-201ENST00000316436 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LSMEM2-201ENST00000316436 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.19■■□□□ 1.14
LSMEM2-201ENST00000316436 TMF1P82094 1093 aa22.18■■□□□ 1.14
LSMEM2-201ENST00000316436 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.18■■□□□ 1.14
LSMEM2-201ENST00000316436 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.17■■□□□ 1.14
LSMEM2-201ENST00000316436 USP32Q8NFA0 1604 aa22.17■■□□□ 1.14
LSMEM2-201ENST00000316436 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.16■■□□□ 1.14
LSMEM2-201ENST00000316436 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.16■■□□□ 1.14
LSMEM2-201ENST00000316436 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LSMEM2-201ENST00000316436 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.15■■□□□ 1.14
LSMEM2-201ENST00000316436 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.14■■□□□ 1.14
LSMEM2-201ENST00000316436 EVC2Q86UK5 1308 aa22.13■■□□□ 1.13
LSMEM2-201ENST00000316436 ATP7BP35670 1465 aa22.13■■□□□ 1.13
LSMEM2-201ENST00000316436 TMEM94Q12767 1356 aa22.12■■□□□ 1.13
LSMEM2-201ENST00000316436 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LSMEM2-201ENST00000316436 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
LSMEM2-201ENST00000316436 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
LSMEM2-201ENST00000316436 CABP2Q9NPB3 220 aa22.09■■□□□ 1.13
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC24A1O60721 1099 aa22.09■■□□□ 1.13
LSMEM2-201ENST00000316436 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.09■■□□□ 1.13
LSMEM2-201ENST00000316436 CDK19Q9BWU1 502 aa22.09■■□□□ 1.13
LSMEM2-201ENST00000316436 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.08■■□□□ 1.12
LSMEM2-201ENST00000316436 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.07■■□□□ 1.12
LSMEM2-201ENST00000316436 ITSN1Q15811 1721 aa22.07■■□□□ 1.12
LSMEM2-201ENST00000316436 CDCA8Q53HL2 280 aa22.06■■□□□ 1.12
LSMEM2-201ENST00000316436 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LSMEM2-201ENST00000316436 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LSMEM2-201ENST00000316436 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LSMEM2-201ENST00000316436 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.04■■□□□ 1.12
LSMEM2-201ENST00000316436 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.03■■□□□ 1.12
LSMEM2-201ENST00000316436 DCCP43146 1447 aa22.03■■□□□ 1.12
LSMEM2-201ENST00000316436 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.03■■□□□ 1.12
LSMEM2-201ENST00000316436 AKAP12Q02952 1782 aa22.01■■□□□ 1.11
LSMEM2-201ENST00000316436 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22■■□□□ 1.11
LSMEM2-201ENST00000316436 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
LSMEM2-201ENST00000316436 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.98■■□□□ 1.11
LSMEM2-201ENST00000316436 C14orf37Q86TY3 774 aa21.98■■□□□ 1.11
LSMEM2-201ENST00000316436 MST1RQ04912 1400 aa21.98■■□□□ 1.11
LSMEM2-201ENST00000316436 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.98■■□□□ 1.11
LSMEM2-201ENST00000316436 NUTM2FA1L443 756 aa21.97■■□□□ 1.11
LSMEM2-201ENST00000316436 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.97■■□□□ 1.11
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.96■■□□□ 1.11
LSMEM2-201ENST00000316436 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.96■■□□□ 1.11
LSMEM2-201ENST00000316436 MSH6P52701 1360 aa21.95■■□□□ 1.11
LSMEM2-201ENST00000316436 A0A1W2PP64 1363 aa21.95■■□□□ 1.1
LSMEM2-201ENST00000316436 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.95■■□□□ 1.1
LSMEM2-201ENST00000316436 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.95■■□□□ 1.1
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LSMEM2-201ENST00000316436 PANK3Q9H999 370 aa21.93■■□□□ 1.1
LSMEM2-201ENST00000316436 CABP1Q9NZU7 370 aa21.93■■□□□ 1.1
LSMEM2-201ENST00000316436 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
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LSMEM2-201ENST00000316436 KIF1AQ12756 1690 aa21.92■■□□□ 1.1
LSMEM2-201ENST00000316436 CERKQ8TCT0 537 aa21.9■■□□□ 1.1
LSMEM2-201ENST00000316436 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.9■■□□□ 1.1
LSMEM2-201ENST00000316436 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
LSMEM2-201ENST00000316436 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.89■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.88■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.87■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 ATF3P18847 181 aa21.87■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.86■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 ACEP12821 1306 aa21.85■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 ORAI2Q96SN7 254 aa21.84■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 USP6P35125 1406 aa21.84■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.84■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.83■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 SSH2Q76I76 1423 aa21.83■■□□□ 1.09
LSMEM2-201ENST00000316436 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.83■■□□□ 1.08
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LSMEM2-201ENST00000316436 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.82■■□□□ 1.08
LSMEM2-201ENST00000316436 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.81■■□□□ 1.08
LSMEM2-201ENST00000316436 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
LSMEM2-201ENST00000316436 FBXO41Q8TF61 875 aa21.81■■□□□ 1.08
LSMEM2-201ENST00000316436 PIK3C2AO00443 1686 aa21.81■■□□□ 1.08
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LSMEM2-201ENST00000316436 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.8■■□□□ 1.08
LSMEM2-201ENST00000316436 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.79■■□□□ 1.08
LSMEM2-201ENST00000316436 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.78■■□□□ 1.08
LSMEM2-201ENST00000316436 USP54Q70EL1 1684 aa21.77■■□□□ 1.08
LSMEM2-201ENST00000316436 PXDNQ92626 1479 aa21.77■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 BRINP3Q76B58 766 aa21.77■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 SLAIN2Q9P270 581 aa21.77■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.77■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
LSMEM2-201ENST00000316436 ALS2Q96Q42 1657 aa21.75■■□□□ 1.07
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