RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PTPRTO14522 1441 aa11.18□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 MTHFSP49914 203 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 WWC1Q8IX03 1113 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 KIF16BQ96L93 1317 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 NOS1P29475 1434 aa11.17□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 MYOM2P54296 1465 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 CD109Q6YHK3 1445 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.16□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 BCAR3O75815 825 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 TET3O43151 1660 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 PANK1Q8TE04 598 aa11.15□□□□□ -0.62
HERC3-201ENST00000264345 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa11.15□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 ABCC11Q96J66 1382 aa11.14□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 NFKBIBQ15653 356 aa11.14□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 C20orf194Q5TEA3 1177 aa11.14□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 TMEM132EQ6IEE7 984 aa11.14□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa11.14□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 ASXL2Q76L83 1435 aa11.14□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 CCDC27Q2M243 656 aa11.13□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 E9PCH4 1651 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 RIPK4P57078 832 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 CABP2Q9NPB3 220 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 ZNF428Q96B54 188 aa11.12□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 GBP4Q96PP9 640 aa11.11□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 MADDQ8WXG6 1647 aa11.11□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 RARSP54136 660 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 MVPQ14764 893 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 KDM2BQ8NHM5 1336 aa11.11□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 SLC4A3P48751 1232 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.1□□□□□ -0.63
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HERC3-201ENST00000264345 BCL2L13Q9BXK5 485 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.1□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 CLASP1Q7Z460 1538 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 IL16Q14005 1332 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.09□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
HERC3-201ENST00000264345 COG3Q96JB2 828 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 KIF1BO60333 1816 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 GGNBP2Q9H3C7 697 aa11.08□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 CHMP5Q9NZZ3 219 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 CLTCL1P53675 1640 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 FCHSD2O94868 740 aa11.07□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 CEP152O94986 1710 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 ZNF521Q96K83 1311 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 ERVK-7P63135 1459 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 ALDH1L2Q3SY69 923 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 C22orf23Q9BZE7 217 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.06□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 PRAM1Q96QH2 718 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 ZMYM3Q14202 1370 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 HMMRO75330 724 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 GCC1Q96CN9 775 aa11.05□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 C8orf34Q49A92 452 aa11.04□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 CDK19Q9BWU1 502 aa11.04□□□□□ -0.64
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HERC3-201ENST00000264345 IQGAP1P46940 1657 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 EFCAB6Q5THR3 1501 aa11.03□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD45Q5TZF3 282 aa11.02□□□□□ -0.64
HERC3-201ENST00000264345 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
HERC3-201ENST00000264345 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.02□□□□□ -0.65
HERC3-201ENST00000264345 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.02□□□□□ -0.65
HERC3-201ENST00000264345 LMTK2Q8IWU2 1503 aa11.02□□□□□ -0.65
HERC3-201ENST00000264345 ZFYVE9O95405 1425 aa11.02□□□□□ -0.65
HERC3-201ENST00000264345 IGHDP01880 384 aa11.01□□□□□ -0.65
HERC3-201ENST00000264345 MLECQ14165 292 aa11.01□□□□□ -0.65
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